More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2129 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.37 
 
 		 791 aa  663    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  62.84 
 
 		 824 aa  664    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 988 aa  1982    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  71.73 
 
 		 808 aa  744    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.92 
 
 		 799 aa  624  1e-177  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  40.68 
 
 		 760 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  41.14 
 
 		 729 aa  357  5.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  42.83 
 
 		 712 aa  343  7e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  39.89 
 
 		 726 aa  340  7e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  40.19 
 
 		 723 aa  338  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  38.68 
 
 		 799 aa  324  5e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  40.12 
 
 		 727 aa  318  3e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  37.03 
 
 		 693 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.73 
 
 		 747 aa  283  1e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.07 
 
 		 746 aa  280  7e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.8 
 
 		 747 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.55 
 
 		 662 aa  271  5.9999999999999995e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.4 
 
 		 739 aa  270  8e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.33 
 
 		 694 aa  264  6.999999999999999e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.3 
 
 		 751 aa  258  4e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.42 
 
 		 756 aa  257  8e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.56 
 
 		 707 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.88 
 
 		 707 aa  239  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.08 
 
 		 707 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.18 
 
 		 709 aa  225  3e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.89 
 
 		 715 aa  222  3e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.9 
 
 		 1265 aa  201  6e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.98 
 
 		 710 aa  197  7e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.43 
 
 		 708 aa  189  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.16 
 
 		 729 aa  182  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.54 
 
 		 706 aa  180  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.99 
 
 		 700 aa  176  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.92 
 
 		 780 aa  147  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.87 
 
 		 803 aa  139  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.33 
 
 		 785 aa  138  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.33 
 
 		 807 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.69 
 
 		 800 aa  124  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.6 
 
 		 810 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.27 
 
 		 811 aa  121  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.87 
 
 		 811 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.91 
 
 		 820 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.1 
 
 		 816 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.93 
 
 		 1230 aa  112  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.29 
 
 		 669 aa  110  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.06 
 
 		 811 aa  109  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  30 
 
 		 2189 aa  108  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  29.31 
 
 		 1767 aa  108  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  34.53 
 
 		 903 aa  107  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.77 
 
 		 684 aa  107  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  32.14 
 
 		 874 aa  107  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  31.11 
 
 		 825 aa  106  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  29.75 
 
 		 2157 aa  106  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.37 
 
 		 1166 aa  102  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.92 
 
 		 1004 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.44 
 
 		 825 aa  100  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.58 
 
 		 697 aa  100  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.061394 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  34.04 
 
 		 1942 aa  100  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  25.62 
 
 		 1173 aa  99.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  27.67 
 
 		 1173 aa  99.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  31.34 
 
 		 1060 aa  98.2  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  28.32 
 
 		 2152 aa  97.8  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.17 
 
 		 695 aa  97.8  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2503  DEAD/DEAH box helicase-like  30.67 
 
 		 701 aa  97.8  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222742  normal  0.294558 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1952  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.96 
 
 		 699 aa  97.4  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.79 
 
 		 1004 aa  97.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  25.31 
 
 		 882 aa  96.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  26.05 
 
 		 1770 aa  95.9  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.07 
 
 		 1318 aa  95.5  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  25.6 
 
 		 1055 aa  95.1  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.65 
 
 		 688 aa  94.7  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.6 
 
 		 727 aa  94.7  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  26.85 
 
 		 901 aa  94  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.57 
 
 		 952 aa  94.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.87 
 
 		 667 aa  94  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.86 
 
 		 894 aa  92.4  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  29.44 
 
 		 1589 aa  92  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  30.12 
 
 		 885 aa  91.3  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  30 
 
 		 2015 aa  90.5  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  32.57 
 
 		 924 aa  89.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.35 
 
 		 1085 aa  89.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.53 
 
 		 861 aa  89.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  28.52 
 
 		 2208 aa  89  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.84 
 
 		 984 aa  89  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.47 
 
 		 927 aa  89  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  30.47 
 
 		 927 aa  89  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  31.65 
 
 		 1165 aa  89  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  31.3 
 
 		 908 aa  88.6  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  32.27 
 
 		 869 aa  88.2  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  37.34 
 
 		 926 aa  87.8  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.48 
 
 		 845 aa  87.4  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.34 
 
 		 1197 aa  87.8  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  31.84 
 
 		 952 aa  86.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  30.87 
 
 		 908 aa  86.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  28.44 
 
 		 1710 aa  87  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.46 
 
 		 951 aa  86.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  28.47 
 
 		 2111 aa  86.7  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  35.4 
 
 		 877 aa  86.3  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  31.34 
 
 		 924 aa  86.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.74 
 
 		 838 aa  85.9  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  32.72 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>