More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0308 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  73.39 
 
 		 697 aa  1024    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.061394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 688 aa  1414    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1952  DEAD/DEAH box helicase domain protein  70.13 
 
 		 699 aa  984    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  72.05 
 
 		 684 aa  988    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  91.28 
 
 		 727 aa  1284    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  45.37 
 
 		 825 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.54 
 
 		 825 aa  554  1e-156  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.99 
 
 		 820 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  44.58 
 
 		 903 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.85 
 
 		 669 aa  499  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.65 
 
 		 667 aa  477  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.48 
 
 		 695 aa  474  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.01 
 
 		 816 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2503  DEAD/DEAH box helicase-like  40.27 
 
 		 701 aa  439  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222742  normal  0.294558 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.76 
 
 		 811 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.48 
 
 		 811 aa  425  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.43 
 
 		 810 aa  414  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.87 
 
 		 811 aa  413  1e-114  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.17 
 
 		 756 aa  174  6.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.64 
 
 		 747 aa  163  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  28.46 
 
 		 723 aa  160  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  29.32 
 
 		 824 aa  160  9e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  28.71 
 
 		 712 aa  158  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.64 
 
 		 747 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.52 
 
 		 706 aa  157  6e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  26.65 
 
 		 693 aa  156  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.83 
 
 		 746 aa  156  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.16 
 
 		 751 aa  152  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  28.44 
 
 		 727 aa  152  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.04 
 
 		 715 aa  151  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  27.94 
 
 		 799 aa  150  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.95 
 
 		 791 aa  148  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.86 
 
 		 710 aa  148  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  29.95 
 
 		 760 aa  147  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.19 
 
 		 707 aa  147  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.63 
 
 		 694 aa  146  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  31 
 
 		 726 aa  146  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.17 
 
 		 707 aa  144  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  27.13 
 
 		 808 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.15 
 
 		 707 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.01 
 
 		 799 aa  140  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  27.37 
 
 		 729 aa  140  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.17 
 
 		 708 aa  140  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.4 
 
 		 709 aa  139  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.92 
 
 		 729 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.86 
 
 		 739 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.5 
 
 		 657 aa  126  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.02 
 
 		 700 aa  123  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.66 
 
 		 803 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.89 
 
 		 800 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.6 
 
 		 807 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.74 
 
 		 1265 aa  114  9e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.97 
 
 		 785 aa  111  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.85 
 
 		 780 aa  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.53 
 
 		 845 aa  108  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  24.59 
 
 		 1767 aa  108  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  26.97 
 
 		 889 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.68 
 
 		 662 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  27 
 
 		 893 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  25.17 
 
 		 1465 aa  100  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  24.42 
 
 		 2015 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  25.43 
 
 		 1710 aa  99.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.42 
 
 		 1230 aa  98.2  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.68 
 
 		 1004 aa  97.8  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.16 
 
 		 817 aa  97.4  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  24.95 
 
 		 1068 aa  95.9  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.96 
 
 		 890 aa  95.1  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.65 
 
 		 988 aa  94.7  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  26.03 
 
 		 1060 aa  92.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  25.56 
 
 		 908 aa  92.8  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  25.65 
 
 		 908 aa  92.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  28.28 
 
 		 919 aa  91.3  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  22.12 
 
 		 1942 aa  91.3  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  25.88 
 
 		 908 aa  91.3  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.59 
 
 		 837 aa  90.9  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25 
 
 		 837 aa  90.9  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  27.14 
 
 		 926 aa  90.5  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.39 
 
 		 927 aa  88.6  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  26.75 
 
 		 890 aa  88.6  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.37 
 
 		 1318 aa  88.2  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  27.62 
 
 		 869 aa  87.4  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  26.34 
 
 		 1589 aa  87.4  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  23.71 
 
 		 2189 aa  87.4  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  21.83 
 
 		 901 aa  85.9  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.49 
 
 		 1004 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.32 
 
 		 852 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.32 
 
 		 852 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.15 
 
 		 928 aa  85.5  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.32 
 
 		 852 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.33 
 
 		 828 aa  85.9  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  26.93 
 
 		 954 aa  85.1  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  24.36 
 
 		 998 aa  85.1  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.13 
 
 		 937 aa  84.7  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  28.28 
 
 		 986 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  23.74 
 
 		 2157 aa  84.3  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.02 
 
 		 847 aa  84.3  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1463  DEAD/DEAH box helicase-like  27.86 
 
 		 831 aa  84  0.000000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0732  DEAD/DEAH box helicase-like  25.07 
 
 		 828 aa  84.3  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0692265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.49 
 
 		 827 aa  84  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.13 
 
 		 928 aa  84.3  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>