More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1952 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  69.48 
 
 		 684 aa  947    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1952  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 699 aa  1415    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  70.84 
 
 		 727 aa  986    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  79.14 
 
 		 697 aa  1094    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.061394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  70.41 
 
 		 688 aa  994    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  44.67 
 
 		 825 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.11 
 
 		 825 aa  538  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.92 
 
 		 820 aa  509  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.92 
 
 		 669 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.2 
 
 		 667 aa  479  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.84 
 
 		 695 aa  476  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  41.18 
 
 		 903 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2503  DEAD/DEAH box helicase-like  40.64 
 
 		 701 aa  432  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222742  normal  0.294558 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.36 
 
 		 816 aa  422  1e-117  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.38 
 
 		 811 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.38 
 
 		 811 aa  411  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.79 
 
 		 811 aa  398  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.2 
 
 		 810 aa  392  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  29.49 
 
 		 723 aa  165  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.68 
 
 		 756 aa  164  6e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  29.09 
 
 		 824 aa  161  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  28.65 
 
 		 712 aa  160  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.55 
 
 		 707 aa  156  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.12 
 
 		 707 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.41 
 
 		 791 aa  151  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  27.13 
 
 		 693 aa  150  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.5 
 
 		 707 aa  150  8e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.72 
 
 		 694 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  28.85 
 
 		 727 aa  146  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  29.87 
 
 		 760 aa  144  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.07 
 
 		 747 aa  144  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.89 
 
 		 706 aa  143  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.41 
 
 		 799 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  27.29 
 
 		 808 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.1 
 
 		 746 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  28.04 
 
 		 799 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.59 
 
 		 747 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  27.13 
 
 		 726 aa  140  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.38 
 
 		 708 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.55 
 
 		 710 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.83 
 
 		 751 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.01 
 
 		 709 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.88 
 
 		 715 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  27.11 
 
 		 729 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.35 
 
 		 739 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27 
 
 		 700 aa  128  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.49 
 
 		 729 aa  127  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.68 
 
 		 657 aa  108  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.55 
 
 		 1265 aa  107  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  24.72 
 
 		 1767 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  28.12 
 
 		 893 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  27.39 
 
 		 889 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.61 
 
 		 803 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.79 
 
 		 800 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.96 
 
 		 988 aa  98.6  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.23 
 
 		 780 aa  98.6  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.64 
 
 		 785 aa  97.4  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.62 
 
 		 807 aa  97.1  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  24.58 
 
 		 1060 aa  96.7  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.33 
 
 		 662 aa  95.5  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.06 
 
 		 1230 aa  95.1  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  23.32 
 
 		 2015 aa  94.7  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  27.85 
 
 		 919 aa  93.2  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.61 
 
 		 845 aa  92.8  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  26.22 
 
 		 1465 aa  92  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  23.76 
 
 		 1942 aa  92  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  24.79 
 
 		 1710 aa  91.7  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.34 
 
 		 1004 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.46 
 
 		 1004 aa  90.1  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  26.08 
 
 		 926 aa  89  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.34 
 
 		 1318 aa  89  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  23.95 
 
 		 1589 aa  89  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  25.89 
 
 		 908 aa  87  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.88 
 
 		 817 aa  87  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  31.8 
 
 		 953 aa  85.9  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  24.46 
 
 		 924 aa  85.9  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  21.95 
 
 		 2157 aa  84  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  22.71 
 
 		 901 aa  82.8  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  24.16 
 
 		 830 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  27.34 
 
 		 890 aa  82  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  24.88 
 
 		 924 aa  82.4  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  24.53 
 
 		 874 aa  81.6  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.21 
 
 		 890 aa  80.5  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.07 
 
 		 952 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.34 
 
 		 711 aa  79.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.15 
 
 		 851 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  25.67 
 
 		 908 aa  79.7  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.87 
 
 		 847 aa  79.7  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.56 
 
 		 837 aa  79  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.7 
 
 		 708 aa  78.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  27.13 
 
 		 1003 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.48 
 
 		 1053 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.12 
 
 		 950 aa  78.2  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.56 
 
 		 837 aa  78.2  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  25.81 
 
 		 946 aa  77.8  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.74 
 
 		 675 aa  77.4  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  24.37 
 
 		 852 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.65 
 
 		 927 aa  77  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.37 
 
 		 852 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.87 
 
 		 876 aa  76.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>