More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0103 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
729 aa  1426    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.9 
 
 
756 aa  663    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  83.43 
 
 
706 aa  1143    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  80.48 
 
 
708 aa  1075    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  82.22 
 
 
710 aa  1085    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  39.69 
 
 
729 aa  477  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.39 
 
 
739 aa  473  1e-132  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  39.66 
 
 
693 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  40.37 
 
 
726 aa  469  9.999999999999999e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  39.7 
 
 
760 aa  464  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  41.01 
 
 
712 aa  464  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  39 
 
 
799 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  38.73 
 
 
723 aa  451  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.74 
 
 
715 aa  445  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.65 
 
 
791 aa  440  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  39.49 
 
 
727 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.99 
 
 
709 aa  428  1e-118  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.96 
 
 
799 aa  421  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.92 
 
 
694 aa  415  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.64 
 
 
700 aa  401  9.999999999999999e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.74 
 
 
707 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  38.35 
 
 
808 aa  391  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.59 
 
 
707 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.64 
 
 
707 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.54 
 
 
751 aa  372  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32 
 
 
747 aa  368  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.87 
 
 
746 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.74 
 
 
747 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.28 
 
 
662 aa  359  8e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  43.08 
 
 
824 aa  359  9.999999999999999e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.86 
 
 
807 aa  252  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.81 
 
 
800 aa  248  4e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.29 
 
 
780 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
785 aa  240  6.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.3 
 
 
1265 aa  233  9e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.06 
 
 
803 aa  233  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.07 
 
 
1004 aa  194  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.05 
 
 
988 aa  194  5e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.27 
 
 
820 aa  191  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.69 
 
 
1004 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.41 
 
 
695 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  30.61 
 
 
874 aa  174  5e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.04 
 
 
825 aa  171  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  31.97 
 
 
1767 aa  171  6e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  28.72 
 
 
2189 aa  169  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.1 
 
 
952 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.02 
 
 
816 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.2 
 
 
810 aa  163  9e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  29.5 
 
 
2208 aa  163  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  28.87 
 
 
825 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0142598 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  28.14 
 
 
901 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  31.49 
 
 
908 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.6 
 
 
667 aa  161  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  33.5 
 
 
905 aa  160  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  31.65 
 
 
903 aa  160  7e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.11 
 
 
811 aa  160  8e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  31.25 
 
 
908 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  31.25 
 
 
908 aa  159  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.46 
 
 
811 aa  159  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  31.94 
 
 
908 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  28.7 
 
 
2111 aa  158  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2503  DEAD/DEAH box helicase-like  34.24 
 
 
701 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222742  normal  0.294558 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.68 
 
 
927 aa  157  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  32.59 
 
 
924 aa  157  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  31.44 
 
 
927 aa  157  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  32.63 
 
 
1055 aa  156  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  32.43 
 
 
924 aa  156  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  33.01 
 
 
919 aa  155  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  32.93 
 
 
926 aa  155  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.95 
 
 
1230 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  30.79 
 
 
2157 aa  154  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  27.62 
 
 
2015 aa  154  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  31.98 
 
 
904 aa  153  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  32.83 
 
 
906 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.82 
 
 
919 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  32.34 
 
 
893 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  32.75 
 
 
890 aa  151  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.75 
 
 
669 aa  151  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  33.25 
 
 
952 aa  151  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.09 
 
 
811 aa  150  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  26.45 
 
 
1942 aa  149  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  32.38 
 
 
924 aa  148  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  25.61 
 
 
1465 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  31.46 
 
 
906 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.11 
 
 
918 aa  147  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.11 
 
 
918 aa  147  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.11 
 
 
918 aa  147  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  28.25 
 
 
2152 aa  145  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  31.92 
 
 
918 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.71 
 
 
762 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.01 
 
 
838 aa  145  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  32.38 
 
 
889 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  29.37 
 
 
1589 aa  145  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.63 
 
 
684 aa  145  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.79 
 
 
1318 aa  144  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.81 
 
 
817 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  31.32 
 
 
935 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  31.17 
 
 
909 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.74 
 
 
922 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  31.07 
 
 
1060 aa  141  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.630707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>