More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1324 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  58.83 
 
 		 889 aa  1045    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  49.33 
 
 		 967 aa  873    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  54.02 
 
 		 927 aa  948    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  58.81 
 
 		 893 aa  1050    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  59.62 
 
 		 926 aa  1008    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  58.84 
 
 		 924 aa  1013    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  49.66 
 
 		 908 aa  889    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 919 aa  1883    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  49.23 
 
 		 967 aa  871    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  55.88 
 
 		 924 aa  994    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  49.21 
 
 		 1003 aa  907    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  58.53 
 
 		 905 aa  1056    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  59.86 
 
 		 890 aa  1026    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  49.44 
 
 		 908 aa  882    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  49.78 
 
 		 908 aa  875    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  54.13 
 
 		 927 aa  944    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  56.55 
 
 		 924 aa  990    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  49.78 
 
 		 908 aa  885    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  38.55 
 
 		 1055 aa  569  1e-161  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  34.07 
 
 		 904 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.33 
 
 		 984 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.66 
 
 		 952 aa  391  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  32.68 
 
 		 936 aa  392  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  34.28 
 
 		 906 aa  389  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  30.92 
 
 		 953 aa  380  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.62 
 
 		 951 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.19 
 
 		 917 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  33.3 
 
 		 906 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.37 
 
 		 950 aa  375  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  33.8 
 
 		 918 aa  375  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33 
 
 		 918 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33 
 
 		 918 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.03 
 
 		 951 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  33.23 
 
 		 972 aa  369  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.82 
 
 		 918 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.51 
 
 		 931 aa  366  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  44.49 
 
 		 916 aa  366  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.62 
 
 		 919 aa  366  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.83 
 
 		 932 aa  366  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.21 
 
 		 921 aa  364  4e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  32 
 
 		 909 aa  364  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.94 
 
 		 929 aa  363  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.73 
 
 		 996 aa  362  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  38.79 
 
 		 877 aa  355  2e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  42.62 
 
 		 952 aa  352  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  42.39 
 
 		 935 aa  352  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.52 
 
 		 922 aa  348  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.23 
 
 		 964 aa  346  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  31.72 
 
 		 940 aa  343  9e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.58 
 
 		 981 aa  340  7e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  41.14 
 
 		 863 aa  339  9.999999999999999e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.96 
 
 		 933 aa  329  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  38.13 
 
 		 933 aa  319  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  38.65 
 
 		 1073 aa  316  9.999999999999999e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.47 
 
 		 762 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  37.67 
 
 		 1068 aa  316  9.999999999999999e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.08 
 
 		 815 aa  314  4.999999999999999e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  37.62 
 
 		 1068 aa  311  4e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  38.04 
 
 		 998 aa  308  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  28.12 
 
 		 872 aa  299  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.55 
 
 		 843 aa  288  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.29 
 
 		 709 aa  283  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.64 
 
 		 817 aa  246  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.69 
 
 		 947 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.4 
 
 		 990 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  51.24 
 
 		 994 aa  212  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  51.38 
 
 		 1026 aa  210  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  51.2 
 
 		 961 aa  208  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.13 
 
 		 950 aa  207  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.33 
 
 		 868 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.02 
 
 		 861 aa  204  8e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.23 
 
 		 861 aa  203  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.59 
 
 		 848 aa  197  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.67 
 
 		 845 aa  196  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  30.69 
 
 		 869 aa  196  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  29.91 
 
 		 861 aa  195  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.52 
 
 		 847 aa  194  9e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.57 
 
 		 710 aa  193  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  31.26 
 
 		 842 aa  192  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.17 
 
 		 837 aa  192  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.51 
 
 		 876 aa  191  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.64 
 
 		 838 aa  191  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.63 
 
 		 873 aa  191  5.999999999999999e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  46.33 
 
 		 1023 aa  191  7e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.2 
 
 		 894 aa  189  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  32.71 
 
 		 853 aa  188  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.96 
 
 		 861 aa  187  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.98 
 
 		 847 aa  187  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  32.12 
 
 		 855 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.86 
 
 		 832 aa  185  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.28 
 
 		 950 aa  185  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.69 
 
 		 827 aa  185  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.5 
 
 		 853 aa  184  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.52 
 
 		 852 aa  184  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.27 
 
 		 852 aa  184  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.27 
 
 		 852 aa  184  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.66 
 
 		 837 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.74 
 
 		 851 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  31.07 
 
 		 842 aa  182  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.38 
 
 		 832 aa  181  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>