More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1872 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.58 
 
 		 922 aa  916    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  59.25 
 
 		 904 aa  1006    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.79 
 
 		 951 aa  865    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.72 
 
 		 996 aa  841    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  54.37 
 
 		 947 aa  949    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.73 
 
 		 981 aa  1219    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  51.41 
 
 		 906 aa  798    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.95 
 
 		 917 aa  769    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.43 
 
 		 919 aa  878    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  56.36 
 
 		 918 aa  931    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  52.22 
 
 		 953 aa  862    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  53.38 
 
 		 994 aa  868    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  52.49 
 
 		 940 aa  808    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.29 
 
 		 921 aa  819    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  58.24 
 
 		 909 aa  991    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  53.25 
 
 		 918 aa  845    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  58.43 
 
 		 916 aa  978    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.46 
 
 		 964 aa  956    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  57.98 
 
 		 906 aa  933    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  58.82 
 
 		 936 aa  994    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.74 
 
 		 990 aa  893    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.29 
 
 		 951 aa  945    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.91 
 
 		 984 aa  971    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.25 
 
 		 918 aa  845    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.27 
 
 		 932 aa  768    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.29 
 
 		 950 aa  1052    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.86 
 
 		 929 aa  833    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.28 
 
 		 950 aa  972    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.55 
 
 		 931 aa  1006    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64 
 
 		 933 aa  1088    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  100 
 
 		 952 aa  1874    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  51.65 
 
 		 961 aa  792    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  66.98 
 
 		 972 aa  1235    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  57.25 
 
 		 935 aa  914    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.14 
 
 		 918 aa  845    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  54.38 
 
 		 1026 aa  599  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  54.33 
 
 		 863 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  49.92 
 
 		 877 aa  571  1e-161  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.82 
 
 		 815 aa  438  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  36.13 
 
 		 926 aa  419  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  34.76 
 
 		 889 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  35.57 
 
 		 924 aa  408  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  33.33 
 
 		 924 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.5 
 
 		 952 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  34.35 
 
 		 924 aa  389  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  31.74 
 
 		 905 aa  386  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  30.18 
 
 		 908 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  30.03 
 
 		 908 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  31.93 
 
 		 927 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.93 
 
 		 927 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  32.63 
 
 		 893 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  30.57 
 
 		 967 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  30.47 
 
 		 967 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  34.41 
 
 		 919 aa  369  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  29.24 
 
 		 908 aa  369  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  29.96 
 
 		 1003 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  40.25 
 
 		 908 aa  353  8e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  40.61 
 
 		 1055 aa  351  3e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  39.78 
 
 		 890 aa  339  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  29.68 
 
 		 872 aa  337  9e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  28.02 
 
 		 1068 aa  330  7e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  36.21 
 
 		 1185 aa  320  1e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  28.77 
 
 		 1068 aa  318  3e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  39.06 
 
 		 1239 aa  313  6.999999999999999e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  28.48 
 
 		 998 aa  309  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  38.8 
 
 		 1175 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  37.14 
 
 		 1073 aa  295  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  36.9 
 
 		 933 aa  295  3e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.76 
 
 		 762 aa  271  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.82 
 
 		 709 aa  253  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.94 
 
 		 843 aa  229  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  50.53 
 
 		 1293 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.15 
 
 		 424 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.41 
 
 		 873 aa  175  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  31.5 
 
 		 853 aa  171  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  47.42 
 
 		 1209 aa  168  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  33.33 
 
 		 1023 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  30.32 
 
 		 760 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.41 
 
 		 710 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.9 
 
 		 791 aa  147  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  29.16 
 
 		 723 aa  145  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.11 
 
 		 708 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.95 
 
 		 799 aa  139  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  30.18 
 
 		 824 aa  137  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.61 
 
 		 751 aa  137  9e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.64 
 
 		 756 aa  137  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  29.82 
 
 		 808 aa  136  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  29.86 
 
 		 712 aa  134  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.89 
 
 		 838 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.74 
 
 		 746 aa  132  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.22 
 
 		 747 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.35 
 
 		 1004 aa  131  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.86 
 
 		 807 aa  131  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.93 
 
 		 747 aa  130  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.23 
 
 		 950 aa  130  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40 
 
 		 835 aa  127  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.44 
 
 		 832 aa  127  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.91 
 
 		 847 aa  126  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  28.06 
 
 		 727 aa  125  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.98 
 
 		 848 aa  125  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>