More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3167 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.34 
 
 		 922 aa  1122    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.09 
 
 		 984 aa  870    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  58 
 
 		 918 aa  992    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.09 
 
 		 933 aa  875    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  54.35 
 
 		 952 aa  858    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  55.07 
 
 		 947 aa  957    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  48.07 
 
 		 994 aa  789    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 919 aa  1849    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  54.76 
 
 		 906 aa  878    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.31 
 
 		 921 aa  868    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.34 
 
 		 931 aa  923    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.29 
 
 		 950 aa  922    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.08 
 
 		 950 aa  872    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  53.07 
 
 		 940 aa  863    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  56.35 
 
 		 918 aa  910    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.14 
 
 		 996 aa  877    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  65.33 
 
 		 935 aa  1124    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.54 
 
 		 964 aa  864    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  57.81 
 
 		 916 aa  953    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  57.66 
 
 		 906 aa  953    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.46 
 
 		 932 aa  847    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.36 
 
 		 951 aa  934    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  56.49 
 
 		 936 aa  952    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  56.77 
 
 		 909 aa  959    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.35 
 
 		 918 aa  910    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.41 
 
 		 951 aa  964    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.45 
 
 		 929 aa  894    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.4 
 
 		 917 aa  849    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  53.73 
 
 		 972 aa  908    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  50.1 
 
 		 953 aa  839    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  56.42 
 
 		 904 aa  960    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.56 
 
 		 981 aa  924    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.35 
 
 		 918 aa  908    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.02 
 
 		 990 aa  620  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  52.02 
 
 		 1026 aa  581  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  49.33 
 
 		 877 aa  543  1e-153  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  49.05 
 
 		 863 aa  536  1e-151  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  34.68 
 
 		 889 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.1 
 
 		 815 aa  436  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.18 
 
 		 952 aa  413  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  31.72 
 
 		 908 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  33.89 
 
 		 924 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  32.75 
 
 		 905 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  30.79 
 
 		 908 aa  409  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  31.07 
 
 		 908 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  34.27 
 
 		 924 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  33.3 
 
 		 919 aa  389  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.24 
 
 		 927 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  44.23 
 
 		 926 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  29.93 
 
 		 1003 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  45.15 
 
 		 893 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  30.07 
 
 		 967 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  32.82 
 
 		 927 aa  386  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  45.3 
 
 		 924 aa  381  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  42.68 
 
 		 908 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  29.77 
 
 		 967 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  43.83 
 
 		 890 aa  369  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  31.4 
 
 		 872 aa  351  4e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  41.44 
 
 		 1055 aa  345  2e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  29.56 
 
 		 1073 aa  344  5e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  29 
 
 		 1068 aa  331  4e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  28.82 
 
 		 998 aa  306  1.0000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  37.24 
 
 		 933 aa  303  7.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  68.75 
 
 		 961 aa  298  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  34.36 
 
 		 1068 aa  298  4e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  34.72 
 
 		 1239 aa  288  2.9999999999999996e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.39 
 
 		 762 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.68 
 
 		 843 aa  285  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.14 
 
 		 709 aa  272  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.01 
 
 		 847 aa  193  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.75 
 
 		 817 aa  192  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.98 
 
 		 950 aa  189  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.08 
 
 		 848 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  48.33 
 
 		 1293 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  48.48 
 
 		 1185 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  26.88 
 
 		 1023 aa  185  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.35 
 
 		 1231 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.29 
 
 		 873 aa  181  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  32.83 
 
 		 877 aa  181  5.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.56 
 
 		 861 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.42 
 
 		 847 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.91 
 
 		 845 aa  180  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.56 
 
 		 861 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.83 
 
 		 837 aa  179  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  31.31 
 
 		 830 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.53 
 
 		 835 aa  179  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  35.01 
 
 		 885 aa  178  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.67 
 
 		 852 aa  178  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.67 
 
 		 852 aa  178  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.67 
 
 		 852 aa  177  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.66 
 
 		 837 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.36 
 
 		 870 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  29.94 
 
 		 861 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.59 
 
 		 851 aa  174  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.41 
 
 		 894 aa  174  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  31.91 
 
 		 853 aa  173  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.07 
 
 		 424 aa  170  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.83 
 
 		 876 aa  169  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  47.8 
 
 		 1175 aa  169  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.98 
 
 		 832 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>