More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1820 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.07 
 
 		 932 aa  798    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.42 
 
 		 919 aa  931    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.55 
 
 		 950 aa  1221    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  56.95 
 
 		 972 aa  1010    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  65.4 
 
 		 947 aa  1204    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.11 
 
 		 981 aa  1001    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  100 
 
 		 904 aa  1824    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  59.01 
 
 		 952 aa  952    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.84 
 
 		 922 aa  1016    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  58.32 
 
 		 1026 aa  702    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.2 
 
 		 990 aa  721    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  50.1 
 
 		 994 aa  841    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  54.64 
 
 		 918 aa  890    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.39 
 
 		 921 aa  872    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.06 
 
 		 964 aa  996    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  61.58 
 
 		 918 aa  1044    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.42 
 
 		 917 aa  839    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  62.8 
 
 		 906 aa  1073    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  73.79 
 
 		 916 aa  1299    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  80.73 
 
 		 909 aa  1486    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  61.2 
 
 		 936 aa  1107    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.64 
 
 		 918 aa  890    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.48 
 
 		 929 aa  884    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.26 
 
 		 951 aa  964    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.32 
 
 		 984 aa  1019    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.94 
 
 		 931 aa  1048    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.04 
 
 		 950 aa  927    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  52.84 
 
 		 953 aa  918    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  60.42 
 
 		 935 aa  1015    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.49 
 
 		 933 aa  967    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.85 
 
 		 996 aa  936    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  54.79 
 
 		 906 aa  872    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  54.02 
 
 		 940 aa  882    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.64 
 
 		 918 aa  889    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.72 
 
 		 951 aa  1151    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  52.39 
 
 		 863 aa  558  1e-157  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  50.25 
 
 		 877 aa  551  1e-155  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  49.68 
 
 		 961 aa  525  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.28 
 
 		 815 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  33.78 
 
 		 893 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  34.51 
 
 		 889 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  33.08 
 
 		 905 aa  426  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  35.4 
 
 		 924 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  31.87 
 
 		 908 aa  422  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  35.53 
 
 		 926 aa  418  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  31.75 
 
 		 908 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  30.71 
 
 		 908 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.8 
 
 		 952 aa  412  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.63 
 
 		 927 aa  409  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  33.62 
 
 		 924 aa  409  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  30.78 
 
 		 1003 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  32.13 
 
 		 967 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  31.32 
 
 		 908 aa  409  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  32.85 
 
 		 927 aa  409  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  32.03 
 
 		 967 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  34.07 
 
 		 919 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  34.52 
 
 		 924 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  33.44 
 
 		 890 aa  373  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  29.88 
 
 		 1068 aa  357  5e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  40.39 
 
 		 1055 aa  355  2.9999999999999997e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  30.9 
 
 		 872 aa  350  5e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  28.45 
 
 		 1068 aa  346  1e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  30.2 
 
 		 933 aa  339  9.999999999999999e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  27.8 
 
 		 1239 aa  338  3.9999999999999995e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  27.21 
 
 		 1073 aa  332  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  29.73 
 
 		 1175 aa  325  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  28.53 
 
 		 998 aa  305  2.0000000000000002e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.38 
 
 		 843 aa  293  7e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.65 
 
 		 762 aa  293  9e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.4 
 
 		 709 aa  265  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  46.93 
 
 		 1185 aa  196  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.78 
 
 		 817 aa  194  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  48.26 
 
 		 1293 aa  192  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  34.34 
 
 		 853 aa  181  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  26.87 
 
 		 1023 aa  181  8e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.43 
 
 		 845 aa  179  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  30.29 
 
 		 842 aa  179  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.72 
 
 		 861 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.72 
 
 		 861 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.07 
 
 		 424 aa  175  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  32.83 
 
 		 861 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  33.25 
 
 		 877 aa  173  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.99 
 
 		 873 aa  172  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.41 
 
 		 835 aa  171  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.2 
 
 		 868 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  45 
 
 		 1209 aa  166  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  29.49 
 
 		 842 aa  164  8.000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.7 
 
 		 848 aa  159  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  30.02 
 
 		 799 aa  157  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  29.97 
 
 		 727 aa  154  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.06 
 
 		 791 aa  154  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.12 
 
 		 700 aa  151  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.07 
 
 		 747 aa  149  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  30.62 
 
 		 723 aa  149  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.39 
 
 		 710 aa  147  9e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  30 
 
 		 824 aa  147  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  29.55 
 
 		 760 aa  146  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.32 
 
 		 746 aa  146  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.57 
 
 		 751 aa  144  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.57 
 
 		 747 aa  144  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>