More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1928 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.58 
 
 		 917 aa  804    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.85 
 
 		 951 aa  881    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  52.81 
 
 		 918 aa  916    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  49.32 
 
 		 953 aa  873    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  54.31 
 
 		 909 aa  998    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  52.43 
 
 		 935 aa  896    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  53.69 
 
 		 947 aa  961    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.58 
 
 		 996 aa  836    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  49.53 
 
 		 906 aa  801    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.65 
 
 		 933 aa  938    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  56.32 
 
 		 904 aa  1026    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  53.97 
 
 		 952 aa  930    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  54.86 
 
 		 916 aa  972    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.54 
 
 		 990 aa  874    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  54.21 
 
 		 972 aa  964    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  49.02 
 
 		 940 aa  809    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.42 
 
 		 918 aa  827    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  82.81 
 
 		 964 aa  1618    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.16 
 
 		 921 aa  801    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  53.73 
 
 		 906 aa  916    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  58.24 
 
 		 994 aa  1014    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 984 aa  1996    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  55.44 
 
 		 936 aa  981    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.17 
 
 		 951 aa  956    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.42 
 
 		 918 aa  827    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.02 
 
 		 929 aa  815    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.11 
 
 		 950 aa  906    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.68 
 
 		 919 aa  847    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.42 
 
 		 931 aa  998    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.14 
 
 		 932 aa  759    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.33 
 
 		 922 aa  889    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.09 
 
 		 981 aa  966    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.81 
 
 		 950 aa  976    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.31 
 
 		 918 aa  822    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  50.5 
 
 		 1026 aa  581  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  49.09 
 
 		 863 aa  555  1e-156  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  47.88 
 
 		 877 aa  535  1e-150  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  46.3 
 
 		 961 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  33.44 
 
 		 893 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  33.51 
 
 		 926 aa  425  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  33.13 
 
 		 924 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  30.6 
 
 		 908 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  30.33 
 
 		 908 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  32.26 
 
 		 889 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  30.73 
 
 		 908 aa  412  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  30.82 
 
 		 905 aa  408  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.8 
 
 		 815 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  32.42 
 
 		 924 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  32.78 
 
 		 924 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  31.33 
 
 		 927 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.06 
 
 		 927 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  31.19 
 
 		 919 aa  390  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  30.28 
 
 		 967 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.82 
 
 		 952 aa  369  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  30.19 
 
 		 967 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  28.1 
 
 		 1003 aa  365  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  40.22 
 
 		 1055 aa  355  2.9999999999999997e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  29.72 
 
 		 872 aa  335  3e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  30.24 
 
 		 1175 aa  320  1e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  37.37 
 
 		 1185 aa  318  3e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  36.94 
 
 		 1239 aa  304  6.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.51 
 
 		 843 aa  294  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  32.19 
 
 		 1073 aa  285  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  32.4 
 
 		 1068 aa  285  3.0000000000000004e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  57.84 
 
 		 890 aa  223  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  26.96 
 
 		 908 aa  218  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.82 
 
 		 709 aa  206  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  50 
 
 		 933 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  48.95 
 
 		 1068 aa  186  3e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  35.5 
 
 		 1209 aa  184  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  25.5 
 
 		 1293 aa  178  3e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  46.84 
 
 		 998 aa  178  6e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.62 
 
 		 424 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.58 
 
 		 762 aa  172  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  25.11 
 
 		 1023 aa  157  9e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.75 
 
 		 950 aa  141  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.18 
 
 		 838 aa  140  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.8 
 
 		 848 aa  137  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.19 
 
 		 707 aa  135  3e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.04 
 
 		 847 aa  135  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.57 
 
 		 710 aa  135  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.67 
 
 		 707 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.21 
 
 		 832 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.08 
 
 		 817 aa  132  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.57 
 
 		 837 aa  131  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  35.06 
 
 		 860 aa  130  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.44 
 
 		 845 aa  130  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  40.57 
 
 		 830 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.77 
 
 		 835 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  39.89 
 
 		 842 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.67 
 
 		 827 aa  129  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  40.72 
 
 		 869 aa  129  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.89 
 
 		 837 aa  129  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  27.97 
 
 		 729 aa  128  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  38.86 
 
 		 891 aa  127  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.24 
 
 		 852 aa  127  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.04 
 
 		 869 aa  126  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.24 
 
 		 852 aa  127  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  39.2 
 
 		 855 aa  126  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.24 
 
 		 852 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>