More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4192 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  51.62 
 
 		 860 aa  819    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.87 
 
 		 894 aa  976    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.74 
 
 		 861 aa  1080    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  63.17 
 
 		 869 aa  1021    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  58.29 
 
 		 885 aa  909    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  69.35 
 
 		 847 aa  1092    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  71.89 
 
 		 838 aa  1157    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  71.05 
 
 		 830 aa  1202    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.3 
 
 		 873 aa  956    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  60.94 
 
 		 877 aa  976    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.84 
 
 		 710 aa  862    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.37 
 
 		 852 aa  1092    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  47.98 
 
 		 861 aa  730    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  81.63 
 
 		 885 aa  1304    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.44 
 
 		 866 aa  1028    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  53.17 
 
 		 842 aa  864    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  54.76 
 
 		 853 aa  875    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  68.59 
 
 		 837 aa  1098    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1821  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.09 
 
 		 831 aa  1033    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  71.24 
 
 		 837 aa  1177    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1716  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  77.39 
 
 		 836 aa  1219    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64793  hitchhiker  0.00121267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  67.37 
 
 		 852 aa  1092    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.83 
 
 		 856 aa  1082    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.82 
 
 		 876 aa  766    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  68.26 
 
 		 832 aa  1132    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.77 
 
 		 848 aa  1163    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.63 
 
 		 847 aa  1154    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  70.57 
 
 		 835 aa  1174    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  76.73 
 
 		 827 aa  1260    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2490  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.77 
 
 		 865 aa  873    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33618  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.37 
 
 		 852 aa  1092    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.94 
 
 		 851 aa  1095    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.38 
 
 		 861 aa  728    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.61 
 
 		 861 aa  736    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  73.37 
 
 		 842 aa  1221    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.78 
 
 		 853 aa  964    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  58.72 
 
 		 891 aa  974    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.61 
 
 		 869 aa  847    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  73.52 
 
 		 870 aa  1240    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 950 aa  1908    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  72.82 
 
 		 1231 aa  1254    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.39 
 
 		 832 aa  1081    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  54.43 
 
 		 855 aa  863    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.15 
 
 		 868 aa  731    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.53 
 
 		 817 aa  269  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.01 
 
 		 845 aa  214  7.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  29.65 
 
 		 908 aa  203  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  31.73 
 
 		 893 aa  202  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  31.96 
 
 		 908 aa  198  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  32.22 
 
 		 908 aa  197  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  32.22 
 
 		 908 aa  196  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  34.23 
 
 		 905 aa  195  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  34.16 
 
 		 889 aa  194  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.07 
 
 		 952 aa  194  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  32.03 
 
 		 890 aa  190  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  31.45 
 
 		 924 aa  189  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.84 
 
 		 762 aa  188  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  29.35 
 
 		 927 aa  188  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  28.95 
 
 		 872 aa  187  6e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.25 
 
 		 815 aa  187  6e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.13 
 
 		 927 aa  187  8e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  30.84 
 
 		 924 aa  185  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  30.28 
 
 		 919 aa  185  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  30.04 
 
 		 926 aa  184  6e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  28.54 
 
 		 998 aa  183  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.72 
 
 		 922 aa  181  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  28.73 
 
 		 1003 aa  181  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  30.26 
 
 		 924 aa  180  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  33.18 
 
 		 935 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.38 
 
 		 843 aa  175  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.48 
 
 		 918 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.48 
 
 		 918 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.48 
 
 		 918 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.68 
 
 		 709 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.52 
 
 		 919 aa  158  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.69 
 
 		 694 aa  141  7e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0221  helicase domain protein  31.91 
 
 		 548 aa  140  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.447634  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  40.83 
 
 		 916 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.33 
 
 		 996 aa  137  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  31.51 
 
 		 693 aa  137  8e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  41.38 
 
 		 953 aa  137  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.97 
 
 		 984 aa  136  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.8 
 
 		 950 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.24 
 
 		 990 aa  135  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  27.38 
 
 		 1068 aa  135  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.15 
 
 		 964 aa  134  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  38.64 
 
 		 906 aa  134  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.09 
 
 		 950 aa  134  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.48 
 
 		 706 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.9 
 
 		 947 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.78 
 
 		 931 aa  132  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  42.94 
 
 		 936 aa  131  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  41.54 
 
 		 994 aa  131  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.36 
 
 		 951 aa  130  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  44.57 
 
 		 952 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  39.9 
 
 		 904 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  39 
 
 		 877 aa  128  6e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.92 
 
 		 917 aa  128  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  38.69 
 
 		 863 aa  128  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  41.3 
 
 		 1026 aa  127  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>