More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4867 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  50.21 
 
 		 953 aa  817    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  49.35 
 
 		 994 aa  805    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.39 
 
 		 922 aa  655    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  54.29 
 
 		 947 aa  946    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  56.71 
 
 		 909 aa  1002    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.34 
 
 		 996 aa  860    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  50.26 
 
 		 906 aa  819    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  72.04 
 
 		 1026 aa  917    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 990 aa  1953    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.61 
 
 		 984 aa  888    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.61 
 
 		 933 aa  868    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.39 
 
 		 917 aa  808    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.2 
 
 		 918 aa  863    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.5 
 
 		 964 aa  883    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.3 
 
 		 950 aa  837    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  55.32 
 
 		 906 aa  658    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  52.71 
 
 		 972 aa  924    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  56.57 
 
 		 936 aa  961    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  55.24 
 
 		 935 aa  656    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.2 
 
 		 918 aa  863    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  56.91 
 
 		 916 aa  994    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.66 
 
 		 929 aa  815    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  53.21 
 
 		 952 aa  843    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  56.07 
 
 		 904 aa  729    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.55 
 
 		 981 aa  922    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.8 
 
 		 951 aa  1017    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.2 
 
 		 950 aa  993    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.42 
 
 		 951 aa  946    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  56.56 
 
 		 918 aa  973    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.52 
 
 		 931 aa  961    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.64 
 
 		 921 aa  812    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.1 
 
 		 918 aa  860    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.98 
 
 		 919 aa  603  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.98 
 
 		 932 aa  537  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  45.83 
 
 		 863 aa  488  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  45.17 
 
 		 877 aa  486  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  45.7 
 
 		 961 aa  469  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.89 
 
 		 952 aa  380  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  29.01 
 
 		 908 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  28.99 
 
 		 908 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  29.68 
 
 		 927 aa  366  1e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.51 
 
 		 927 aa  363  9e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  38.47 
 
 		 1055 aa  356  1e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  27.19 
 
 		 1068 aa  338  1.9999999999999998e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  37.39 
 
 		 1185 aa  316  9.999999999999999e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  35.4 
 
 		 1239 aa  310  8e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  37.54 
 
 		 1175 aa  308  5.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  66.04 
 
 		 940 aa  272  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.17 
 
 		 815 aa  232  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  48.37 
 
 		 893 aa  225  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  47.51 
 
 		 908 aa  224  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  50.22 
 
 		 924 aa  224  6e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  50.22 
 
 		 926 aa  222  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  48.03 
 
 		 924 aa  221  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  49.56 
 
 		 924 aa  220  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  51.71 
 
 		 889 aa  220  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  29.73 
 
 		 905 aa  219  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  49.32 
 
 		 890 aa  219  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  44.86 
 
 		 908 aa  218  4e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  54.4 
 
 		 919 aa  213  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  27.73 
 
 		 967 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  27.71 
 
 		 967 aa  211  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  43.39 
 
 		 1003 aa  202  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  51.52 
 
 		 872 aa  198  5.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  51.56 
 
 		 1023 aa  192  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  37.5 
 
 		 1209 aa  192  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  50.26 
 
 		 1073 aa  191  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  48.73 
 
 		 998 aa  191  7e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  48.97 
 
 		 1068 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  47.94 
 
 		 933 aa  184  8.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.6 
 
 		 762 aa  180  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.54 
 
 		 424 aa  174  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.23 
 
 		 843 aa  162  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.93 
 
 		 709 aa  159  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  37.84 
 
 		 1293 aa  143  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.46 
 
 		 848 aa  137  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.6 
 
 		 847 aa  137  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.24 
 
 		 950 aa  135  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  41.49 
 
 		 842 aa  134  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  40.44 
 
 		 838 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.18 
 
 		 861 aa  132  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.18 
 
 		 861 aa  132  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.18 
 
 		 817 aa  132  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  41.03 
 
 		 885 aa  131  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.54 
 
 		 845 aa  130  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  38.27 
 
 		 861 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.1 
 
 		 861 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.05 
 
 		 866 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.66 
 
 		 710 aa  130  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  39.56 
 
 		 891 aa  130  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.69 
 
 		 827 aa  130  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.18 
 
 		 847 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  40.66 
 
 		 853 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38 
 
 		 873 aa  129  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  38.42 
 
 		 869 aa  129  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  37.13 
 
 		 855 aa  129  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.19 
 
 		 852 aa  128  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.19 
 
 		 852 aa  128  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.19 
 
 		 852 aa  128  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.01 
 
 		 837 aa  128  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>