More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2082 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 424 aa  868    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.32 
 
 		 762 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  51.02 
 
 		 889 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  50.77 
 
 		 908 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  44.31 
 
 		 877 aa  191  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  51.91 
 
 		 863 aa  190  4e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  50 
 
 		 905 aa  190  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  49.23 
 
 		 924 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  44.35 
 
 		 890 aa  189  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  48.21 
 
 		 908 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  48.21 
 
 		 908 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  49.23 
 
 		 908 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  43.04 
 
 		 893 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  49.48 
 
 		 926 aa  187  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  47.78 
 
 		 1073 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.9 
 
 		 921 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  49.23 
 
 		 924 aa  186  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.13 
 
 		 952 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.9 
 
 		 929 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  48.45 
 
 		 924 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  47.69 
 
 		 927 aa  183  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  47.69 
 
 		 927 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  49.72 
 
 		 936 aa  182  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  42.27 
 
 		 1185 aa  182  8.000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  43.78 
 
 		 1003 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  42.63 
 
 		 919 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  42.19 
 
 		 906 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  48.35 
 
 		 953 aa  180  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  48.35 
 
 		 906 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.72 
 
 		 951 aa  179  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.8 
 
 		 918 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.8 
 
 		 918 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.8 
 
 		 918 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  46.77 
 
 		 918 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  49.17 
 
 		 916 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.96 
 
 		 950 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  48.44 
 
 		 1055 aa  177  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.92 
 
 		 815 aa  177  4e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  49.17 
 
 		 947 aa  176  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.28 
 
 		 931 aa  176  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  46.74 
 
 		 1239 aa  176  7e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.07 
 
 		 964 aa  176  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  48.15 
 
 		 952 aa  176  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  48.07 
 
 		 904 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  40.89 
 
 		 967 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.62 
 
 		 984 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  40.89 
 
 		 967 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  51.08 
 
 		 1026 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.45 
 
 		 951 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.07 
 
 		 950 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  41.28 
 
 		 994 aa  174  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.54 
 
 		 990 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  46.63 
 
 		 933 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.07 
 
 		 996 aa  174  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  46.99 
 
 		 1293 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  47.8 
 
 		 940 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  46.04 
 
 		 1068 aa  171  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.07 
 
 		 919 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.96 
 
 		 917 aa  169  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  44.28 
 
 		 1068 aa  168  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  48.84 
 
 		 909 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  41.74 
 
 		 1023 aa  169  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.62 
 
 		 933 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.74 
 
 		 932 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  46.24 
 
 		 1175 aa  166  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  44.1 
 
 		 998 aa  166  6.9999999999999995e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  46.7 
 
 		 961 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  45.85 
 
 		 935 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.67 
 
 		 922 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.96 
 
 		 981 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  46.41 
 
 		 972 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  42.62 
 
 		 872 aa  158  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  39.57 
 
 		 1209 aa  148  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.21 
 
 		 709 aa  144  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.91 
 
 		 843 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.11 
 
 		 817 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.76 
 
 		 861 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.76 
 
 		 861 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  38.33 
 
 		 855 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  36.22 
 
 		 861 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.83 
 
 		 832 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.04 
 
 		 845 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  36.46 
 
 		 853 aa  113  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  34.29 
 
 		 842 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.44 
 
 		 869 aa  110  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.52 
 
 		 868 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  33.33 
 
 		 877 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.26 
 
 		 950 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.64 
 
 		 876 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.15 
 
 		 837 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.63 
 
 		 827 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.97 
 
 		 853 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  32.26 
 
 		 860 aa  103  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2490  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.9 
 
 		 865 aa  103  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33618  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.97 
 
 		 873 aa  102  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  32.26 
 
 		 830 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.36 
 
 		 856 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.6 
 
 		 838 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  34.25 
 
 		 885 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  33.7 
 
 		 842 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>