More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85287 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  51.68 
 
 		 1185 aa  707    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  100 
 
 		 1239 aa  2562    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  40.7 
 
 		 872 aa  686    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  47.55 
 
 		 1293 aa  611  1e-173  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  54.85 
 
 		 1175 aa  571  1e-161  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  34.16 
 
 		 1068 aa  546  1e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  41.16 
 
 		 1068 aa  453  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  46.06 
 
 		 1073 aa  446  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  29.42 
 
 		 994 aa  356  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  28.12 
 
 		 909 aa  338  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  27.8 
 
 		 904 aa  337  7e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.57 
 
 		 950 aa  330  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.33 
 
 		 981 aa  324  8e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.58 
 
 		 952 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  38.08 
 
 		 918 aa  318  4e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.88 
 
 		 996 aa  317  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.31 
 
 		 964 aa  315  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.04 
 
 		 990 aa  314  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  30.96 
 
 		 1023 aa  311  4e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.38 
 
 		 917 aa  308  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.31 
 
 		 929 aa  307  7e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.7 
 
 		 933 aa  307  9.000000000000001e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.57 
 
 		 984 aa  307  9.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  35.73 
 
 		 889 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  34.59 
 
 		 936 aa  306  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  36.76 
 
 		 972 aa  304  6.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  37.03 
 
 		 877 aa  301  5e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  35.11 
 
 		 919 aa  301  7e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.28 
 
 		 951 aa  300  8e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  36.88 
 
 		 908 aa  300  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  34.71 
 
 		 906 aa  299  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.01 
 
 		 918 aa  299  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.01 
 
 		 918 aa  299  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.01 
 
 		 918 aa  298  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  36.55 
 
 		 908 aa  298  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  38.78 
 
 		 1055 aa  295  3e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.08 
 
 		 947 aa  295  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  35.58 
 
 		 926 aa  293  1e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  36.29 
 
 		 927 aa  293  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.1 
 
 		 927 aa  292  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.81 
 
 		 932 aa  293  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  36.57 
 
 		 906 aa  292  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  35.98 
 
 		 908 aa  292  3e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.98 
 
 		 950 aa  291  5.0000000000000004e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  36.19 
 
 		 893 aa  290  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.36 
 
 		 762 aa  290  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  35.56 
 
 		 924 aa  287  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  34.8 
 
 		 924 aa  286  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  36.13 
 
 		 924 aa  283  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.27 
 
 		 815 aa  281  6e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  31.94 
 
 		 967 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  31.94 
 
 		 967 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  57.67 
 
 		 933 aa  265  6e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  52.7 
 
 		 998 aa  249  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.66 
 
 		 709 aa  221  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.12 
 
 		 843 aa  211  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  32.89 
 
 		 908 aa  210  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  34.65 
 
 		 1003 aa  196  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  50.53 
 
 		 863 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  46.97 
 
 		 952 aa  184  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.45 
 
 		 951 aa  182  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  45.28 
 
 		 890 aa  181  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  48.06 
 
 		 1026 aa  180  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  45.64 
 
 		 953 aa  180  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  42.67 
 
 		 905 aa  180  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.81 
 
 		 931 aa  176  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  46.38 
 
 		 961 aa  176  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.74 
 
 		 424 aa  176  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  44.91 
 
 		 916 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.55 
 
 		 922 aa  176  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  44.55 
 
 		 935 aa  174  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.42 
 
 		 919 aa  171  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.65 
 
 		 921 aa  170  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  44.16 
 
 		 940 aa  165  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  34.69 
 
 		 1209 aa  145  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.71 
 
 		 845 aa  119  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1821  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.63 
 
 		 831 aa  117  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  36.93 
 
 		 830 aa  115  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.16 
 
 		 710 aa  114  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.16 
 
 		 817 aa  113  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  34.47 
 
 		 838 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.33 
 
 		 827 aa  112  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.12 
 
 		 837 aa  112  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.07 
 
 		 847 aa  112  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2083  DSH domain protein  34.76 
 
 		 516 aa  112  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00750043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.12 
 
 		 1231 aa  112  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.17 
 
 		 856 aa  110  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  34.93 
 
 		 885 aa  110  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1716  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.53 
 
 		 836 aa  111  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64793  hitchhiker  0.00121267 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  37.02 
 
 		 885 aa  110  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.36 
 
 		 832 aa  109  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.66 
 
 		 873 aa  109  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.65 
 
 		 950 aa  109  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.91 
 
 		 869 aa  108  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.84 
 
 		 866 aa  108  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  33.7 
 
 		 842 aa  107  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  31.84 
 
 		 861 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  32.83 
 
 		 891 aa  107  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.8 
 
 		 852 aa  107  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.34 
 
 		 861 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>