More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI02710 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  100 
 
 		 1185 aa  2439    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  49.56 
 
 		 1239 aa  695    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  55.3 
 
 		 1175 aa  587  1e-166  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  52.8 
 
 		 1293 aa  448  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  41.58 
 
 		 872 aa  421  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  41.83 
 
 		 1068 aa  414  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  30.25 
 
 		 906 aa  333  1e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  39.38 
 
 		 994 aa  327  6e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.51 
 
 		 947 aa  326  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.64 
 
 		 933 aa  323  9.000000000000001e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.89 
 
 		 984 aa  322  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.1 
 
 		 964 aa  319  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  29.83 
 
 		 877 aa  313  1e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  38.72 
 
 		 904 aa  312  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  36.67 
 
 		 936 aa  308  4.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  29.52 
 
 		 918 aa  305  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.66 
 
 		 950 aa  304  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  36.23 
 
 		 924 aa  301  4e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.73 
 
 		 929 aa  299  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  34.96 
 
 		 926 aa  298  3e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.25 
 
 		 932 aa  298  5e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  35.83 
 
 		 953 aa  295  4e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37 
 
 		 951 aa  294  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.42 
 
 		 918 aa  291  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.42 
 
 		 918 aa  291  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.42 
 
 		 918 aa  291  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  35.28 
 
 		 906 aa  290  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.34 
 
 		 917 aa  287  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  32.99 
 
 		 967 aa  275  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  53.85 
 
 		 933 aa  251  5e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  54.02 
 
 		 1068 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  52.23 
 
 		 1073 aa  244  9e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  51.57 
 
 		 998 aa  244  9e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  32.07 
 
 		 924 aa  220  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  46.26 
 
 		 1023 aa  206  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  47.66 
 
 		 927 aa  199  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  47.66 
 
 		 927 aa  199  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.3 
 
 		 990 aa  198  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.75 
 
 		 951 aa  195  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  48.37 
 
 		 916 aa  190  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.41 
 
 		 950 aa  189  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50 
 
 		 981 aa  188  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.45 
 
 		 931 aa  189  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  48.08 
 
 		 1026 aa  188  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  47.03 
 
 		 924 aa  188  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.53 
 
 		 952 aa  187  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  46.92 
 
 		 952 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.48 
 
 		 919 aa  186  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  44.64 
 
 		 972 aa  185  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.57 
 
 		 922 aa  184  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45 
 
 		 762 aa  185  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  45.67 
 
 		 905 aa  184  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  48.28 
 
 		 935 aa  184  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  50.27 
 
 		 909 aa  183  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  50 
 
 		 890 aa  182  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.89 
 
 		 921 aa  182  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  49.74 
 
 		 893 aa  182  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.27 
 
 		 424 aa  182  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.47 
 
 		 996 aa  182  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  46.5 
 
 		 889 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  46.54 
 
 		 961 aa  181  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  42.16 
 
 		 908 aa  180  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  42.16 
 
 		 908 aa  181  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  42.44 
 
 		 908 aa  180  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  43.14 
 
 		 908 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  45.27 
 
 		 940 aa  177  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  47.42 
 
 		 919 aa  177  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  43.66 
 
 		 967 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  46.43 
 
 		 1055 aa  172  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  42.45 
 
 		 1003 aa  171  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.67 
 
 		 815 aa  162  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.81 
 
 		 709 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  25.18 
 
 		 863 aa  146  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.76 
 
 		 843 aa  144  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2083  DSH domain protein  26.51 
 
 		 516 aa  140  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00750043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  38.16 
 
 		 1209 aa  135  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.29 
 
 		 845 aa  119  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.55 
 
 		 710 aa  116  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  30.66 
 
 		 861 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30 
 
 		 861 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30 
 
 		 861 aa  114  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.43 
 
 		 817 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.82 
 
 		 950 aa  109  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.74 
 
 		 827 aa  109  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.78 
 
 		 856 aa  109  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1231 aa  109  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  33.17 
 
 		 842 aa  108  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.89 
 
 		 847 aa  108  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.98 
 
 		 894 aa  108  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.47 
 
 		 838 aa  107  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.43 
 
 		 861 aa  107  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.88 
 
 		 832 aa  106  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.52 
 
 		 852 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.83 
 
 		 837 aa  106  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.52 
 
 		 852 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.52 
 
 		 851 aa  107  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1716  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.44 
 
 		 836 aa  107  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64793  hitchhiker  0.00121267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.52 
 
 		 852 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.75 
 
 		 853 aa  106  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.25 
 
 		 848 aa  106  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>