More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_805 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  41.15 
 
 
1293 aa  786    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  100 
 
 
1175 aa  2408    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  54.39 
 
 
1185 aa  598  1e-169  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  54.42 
 
 
1239 aa  586  1e-166  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  35.76 
 
 
1068 aa  565  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.787056 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  35.49 
 
 
1073 aa  546  1e-154  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  35.24 
 
 
1068 aa  541  9.999999999999999e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  36.16 
 
 
998 aa  531  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  52.13 
 
 
872 aa  523  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  44.64 
 
 
933 aa  429  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.95 
 
 
984 aa  328  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  30.23 
 
 
904 aa  325  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  38.61 
 
 
994 aa  323  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.42 
 
 
952 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.98 
 
 
964 aa  311  6.999999999999999e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.67 
 
 
990 aa  307  7e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.5 
 
 
951 aa  306  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.58 
 
 
950 aa  303  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  37.6 
 
 
877 aa  302  3e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  37.06 
 
 
918 aa  301  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  36.09 
 
 
863 aa  301  6e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  36.88 
 
 
936 aa  299  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.58 
 
 
981 aa  298  3e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.94 
 
 
929 aa  297  9e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  36.85 
 
 
906 aa  296  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37 
 
 
933 aa  295  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.66 
 
 
947 aa  295  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.18 
 
 
996 aa  294  8e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  35.62 
 
 
924 aa  293  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  37.15 
 
 
909 aa  291  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.47 
 
 
932 aa  290  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  36.29 
 
 
927 aa  290  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  34.31 
 
 
924 aa  290  1e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  36.33 
 
 
908 aa  290  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  33.61 
 
 
889 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.07 
 
 
918 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.07 
 
 
918 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  36.29 
 
 
927 aa  290  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.07 
 
 
918 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  37.45 
 
 
916 aa  289  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  35.67 
 
 
924 aa  289  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  29.18 
 
 
972 aa  289  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  36.31 
 
 
908 aa  289  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  35.04 
 
 
926 aa  287  8e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  36.33 
 
 
908 aa  284  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  35.77 
 
 
906 aa  284  7.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.03 
 
 
921 aa  284  7.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  35.98 
 
 
893 aa  280  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.52 
 
 
917 aa  278  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  36.36 
 
 
953 aa  269  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  30.22 
 
 
1003 aa  263  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.8 
 
 
762 aa  261  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  33.1 
 
 
967 aa  251  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  33.1 
 
 
967 aa  251  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50379  predicted protein  36.36 
 
 
1023 aa  179  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0819342  normal  0.0284916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  49.25 
 
 
952 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.98 
 
 
950 aa  175  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  50.51 
 
 
1026 aa  174  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  49.47 
 
 
890 aa  170  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  46.28 
 
 
908 aa  170  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.8 
 
 
919 aa  169  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  47.89 
 
 
905 aa  169  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  48.15 
 
 
919 aa  168  6.9999999999999995e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2082  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.24 
 
 
424 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.239089  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  48.02 
 
 
935 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.02 
 
 
922 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  39.56 
 
 
1055 aa  164  6e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.11 
 
 
815 aa  159  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  39.91 
 
 
961 aa  159  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1885  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.9 
 
 
931 aa  157  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49846  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2953  DSH domain protein  36 
 
 
940 aa  150  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000014502  hitchhiker  0.00117174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.93 
 
 
951 aa  140  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.312521 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.72 
 
 
709 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.78 
 
 
843 aa  128  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43406  predicted protein  35.71 
 
 
1209 aa  128  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2083  DSH domain protein  33.47 
 
 
516 aa  122  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00750043  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.92 
 
 
710 aa  113  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.88 
 
 
838 aa  113  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.95 
 
 
817 aa  111  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.19 
 
 
845 aa  110  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.91 
 
 
894 aa  110  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.47 
 
 
837 aa  110  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  39.33 
 
 
869 aa  108  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.94 
 
 
837 aa  107  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.9 
 
 
851 aa  107  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
832 aa  105  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.34 
 
 
847 aa  105  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  37.89 
 
 
830 aa  105  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.65 
 
 
856 aa  105  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.41 
 
 
866 aa  105  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.47 
 
 
827 aa  104  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.41 
 
 
873 aa  104  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  38.32 
 
 
885 aa  104  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.91 
 
 
848 aa  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.71 
 
 
835 aa  103  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.64 
 
 
950 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.9 
 
 
847 aa  102  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.36 
 
 
1231 aa  101  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.07 
 
 
876 aa  101  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.75 
 
 
852 aa  101  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>