More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2815 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.03 
 
 
853 aa  1013    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  68.4 
 
 
847 aa  1112    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1444  helicase domain protein  56.92 
 
 
885 aa  905    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1821  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.76 
 
 
831 aa  1022    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  70.92 
 
 
827 aa  1195    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1695  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.67 
 
 
873 aa  937    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.558592  decreased coverage  0.000760063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1716  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  72.05 
 
 
836 aa  1155    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64793  hitchhiker  0.00121267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  74.67 
 
 
830 aa  1286    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14870  superfamily II RNA helicase  54.07 
 
 
860 aa  874    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.217671  normal  0.750505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  78.12 
 
 
838 aa  1276    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.5 
 
 
869 aa  880    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3405  DEAD/DEAH box helicase-like  48.03 
 
 
861 aa  753    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  67.83 
 
 
885 aa  1142    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3781  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.71 
 
 
876 aa  767    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.485646  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.59 
 
 
861 aa  750    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4778  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.11 
 
 
861 aa  1053    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4192  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  71.24 
 
 
950 aa  1178    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443512  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  53.53 
 
 
842 aa  857    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.82 
 
 
861 aa  753    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  54.48 
 
 
855 aa  877    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.03 
 
 
837 aa  1102    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  76.79 
 
 
832 aa  1289    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451486  normal  0.464159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  72.41 
 
 
1231 aa  1182    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2334  DEAD/DEAH box helicase domain protein  70.28 
 
 
870 aa  1192    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2231  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.52 
 
 
710 aa  947    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.588321  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  66.75 
 
 
852 aa  1108    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0173  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.9 
 
 
856 aa  1085    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114207  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2074  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.79 
 
 
848 aa  1126    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1183  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.26 
 
 
866 aa  1023    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195641  normal  0.316111 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11250  superfamily II RNA helicase  58.53 
 
 
877 aa  950    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303042  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2490  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.07 
 
 
865 aa  902    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33618  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.92 
 
 
847 aa  1105    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000659674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.75 
 
 
852 aa  1108    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.27 
 
 
851 aa  1088    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0773  DEAD/DEAH box helicase domain protein  76.04 
 
 
835 aa  1288    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18660  superfamily II RNA helicase  53.65 
 
 
853 aa  874    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103147  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3468  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.82 
 
 
868 aa  759    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.132888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2373  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.41 
 
 
894 aa  974    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.385543  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  70.67 
 
 
842 aa  1191    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06920  superfamily II RNA helicase  59.63 
 
 
891 aa  997    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  68.41 
 
 
832 aa  1167    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
837 aa  1713    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10920  superfamily II RNA helicase  60.53 
 
 
869 aa  1015    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.769865  normal  0.737548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.63 
 
 
852 aa  1105    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.16 
 
 
817 aa  267  5.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.27 
 
 
845 aa  229  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  29.88 
 
 
1055 aa  209  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  31.22 
 
 
908 aa  204  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  29.07 
 
 
927 aa  200  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  31.17 
 
 
924 aa  200  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.22 
 
 
952 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  29.28 
 
 
926 aa  199  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  33.01 
 
 
905 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  32.93 
 
 
889 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.85 
 
 
927 aa  199  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  30.3 
 
 
924 aa  198  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  31.87 
 
 
924 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  33.17 
 
 
893 aa  195  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  32.11 
 
 
890 aa  193  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  28.37 
 
 
872 aa  191  4e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.17 
 
 
762 aa  191  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  31.19 
 
 
919 aa  184  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.47 
 
 
843 aa  184  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  29.73 
 
 
933 aa  179  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.66 
 
 
919 aa  177  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
815 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  27.18 
 
 
998 aa  169  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.38 
 
 
929 aa  169  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.53 
 
 
709 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.42 
 
 
918 aa  163  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.42 
 
 
918 aa  163  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.42 
 
 
918 aa  163  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0221  helicase domain protein  32.65 
 
 
548 aa  158  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.447634  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.87 
 
 
791 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.05 
 
 
694 aa  139  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.21 
 
 
799 aa  139  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11980  superfamily II RNA helicase  42.02 
 
 
994 aa  133  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.35306  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.17 
 
 
706 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  35.52 
 
 
908 aa  132  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.57 
 
 
984 aa  131  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000527696 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  39.77 
 
 
877 aa  131  6e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  34.97 
 
 
908 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  34.97 
 
 
908 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.04 
 
 
951 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.91 
 
 
964 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4867  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.01 
 
 
990 aa  128  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335008 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.57 
 
 
950 aa  127  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  26.89 
 
 
693 aa  127  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  28.51 
 
 
824 aa  126  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  38.24 
 
 
1026 aa  127  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  30.5 
 
 
723 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.83 
 
 
996 aa  126  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1517  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.8 
 
 
950 aa  126  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.729212  normal  0.376472 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  40.57 
 
 
953 aa  124  9e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  28.61 
 
 
729 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  29.89 
 
 
760 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  39.2 
 
 
863 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  42.05 
 
 
952 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  39.76 
 
 
909 aa  122  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.44 
 
 
707 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>