More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6720 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.69 
 
 
1318 aa  842    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
1230 aa  2432    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.59 
 
 
800 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.4 
 
 
780 aa  195  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.6 
 
 
807 aa  189  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.29 
 
 
791 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.66 
 
 
785 aa  176  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.97 
 
 
756 aa  174  7.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.63 
 
 
694 aa  172  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  31.65 
 
 
723 aa  172  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.55 
 
 
707 aa  171  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.55 
 
 
715 aa  170  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  32.05 
 
 
729 aa  169  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  30.59 
 
 
1767 aa  170  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  28.6 
 
 
1942 aa  170  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  32.77 
 
 
693 aa  169  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.46 
 
 
747 aa  168  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  34.39 
 
 
760 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.22 
 
 
803 aa  168  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.35 
 
 
707 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.23 
 
 
799 aa  166  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  35.05 
 
 
824 aa  164  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.96 
 
 
746 aa  162  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  31.67 
 
 
712 aa  161  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.76 
 
 
707 aa  160  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.08 
 
 
700 aa  159  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.14 
 
 
747 aa  159  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  32.76 
 
 
808 aa  158  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.88 
 
 
710 aa  157  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  26.09 
 
 
2015 aa  155  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  28.68 
 
 
727 aa  154  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  29.82 
 
 
799 aa  154  8e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  28.88 
 
 
1060 aa  154  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.79 
 
 
751 aa  154  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.21 
 
 
709 aa  148  5e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.34 
 
 
708 aa  148  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  26.05 
 
 
1465 aa  144  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.78 
 
 
706 aa  143  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.55 
 
 
729 aa  142  6e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  28.44 
 
 
2157 aa  139  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  28.69 
 
 
2189 aa  139  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  29.85 
 
 
1589 aa  138  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  26.24 
 
 
2208 aa  138  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.98 
 
 
739 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  31.18 
 
 
726 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.35 
 
 
662 aa  134  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  24.19 
 
 
1770 aa  134  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  25.97 
 
 
2111 aa  132  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  29.44 
 
 
901 aa  131  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  25.14 
 
 
2152 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  26.69 
 
 
1710 aa  130  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.54 
 
 
1265 aa  121  9e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.86 
 
 
1004 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.3 
 
 
816 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.22 
 
 
820 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  30.33 
 
 
1165 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.24 
 
 
825 aa  113  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  30.05 
 
 
874 aa  112  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.93 
 
 
988 aa  111  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  28.84 
 
 
1173 aa  108  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  29.28 
 
 
825 aa  106  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.95 
 
 
811 aa  106  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.06 
 
 
1166 aa  104  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  27.8 
 
 
1173 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.67 
 
 
811 aa  103  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.24 
 
 
810 aa  102  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  29.1 
 
 
402 aa  101  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.86 
 
 
1004 aa  101  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05514  DEAD/DEAH box DNA helicase (Mer3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13080)  24.6 
 
 
1385 aa  99.4  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451829  normal  0.647308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  26.98 
 
 
882 aa  99.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.38 
 
 
697 aa  97.4  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.061394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.25 
 
 
972 aa  97.4  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  29.39 
 
 
939 aa  97.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.49 
 
 
811 aa  96.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.67 
 
 
684 aa  95.5  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.36 
 
 
946 aa  95.5  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.9 
 
 
1197 aa  94.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  27.24 
 
 
943 aa  93.6  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  23.59 
 
 
905 aa  93.6  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  26.56 
 
 
903 aa  94  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  25.1 
 
 
889 aa  92.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  27.99 
 
 
898 aa  90.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.05 
 
 
996 aa  90.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.86 
 
 
903 aa  89.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  27.94 
 
 
946 aa  89.7  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.42 
 
 
688 aa  89.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.8 
 
 
909 aa  89  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  26.32 
 
 
926 aa  89  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.14 
 
 
932 aa  88.6  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  25.93 
 
 
890 aa  87.8  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  25.65 
 
 
893 aa  87.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  30.8 
 
 
1055 aa  88.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  28.2 
 
 
954 aa  87.8  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  27.44 
 
 
955 aa  87  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.79 
 
 
916 aa  87  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.53 
 
 
951 aa  87  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.61 
 
 
667 aa  86.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.5 
 
 
944 aa  86.3  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.59 
 
 
669 aa  85.5  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.58 
 
 
727 aa  85.1  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>