More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0138 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  96.11 
 
 		 747 aa  1456    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 746 aa  1503    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  74.24 
 
 		 751 aa  1136    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.67 
 
 		 707 aa  739    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  93.3 
 
 		 747 aa  1421    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.8 
 
 		 707 aa  735    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.73 
 
 		 707 aa  748    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.23 
 
 		 791 aa  495  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65 
 
 		 1265 aa  482  1e-134  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  38.27 
 
 		 729 aa  474  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.62 
 
 		 799 aa  471  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  37.35 
 
 		 712 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  36.64 
 
 		 760 aa  462  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  36.73 
 
 		 723 aa  464  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  36.39 
 
 		 693 aa  451  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  34.5 
 
 		 808 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  35.37 
 
 		 799 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  36.05 
 
 		 726 aa  437  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.22 
 
 		 694 aa  428  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  34.95 
 
 		 727 aa  429  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  34.05 
 
 		 824 aa  427  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.74 
 
 		 756 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.07 
 
 		 739 aa  391  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.09 
 
 		 706 aa  379  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.66 
 
 		 708 aa  376  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.83 
 
 		 709 aa  366  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.8 
 
 		 715 aa  364  4e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.75 
 
 		 710 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.14 
 
 		 662 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.11 
 
 		 700 aa  352  1e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.37 
 
 		 729 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.07 
 
 		 988 aa  263  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.4 
 
 		 803 aa  210  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.21 
 
 		 780 aa  206  9e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  25.99 
 
 		 874 aa  206  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.21 
 
 		 785 aa  205  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.73 
 
 		 807 aa  204  6e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.06 
 
 		 800 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  31.9 
 
 		 2208 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  30.15 
 
 		 1060 aa  171  6e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  28.33 
 
 		 2152 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.07 
 
 		 1318 aa  164  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  30.28 
 
 		 2111 aa  162  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.96 
 
 		 1230 aa  162  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  29.56 
 
 		 2015 aa  159  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  31.7 
 
 		 825 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  28.84 
 
 		 1710 aa  159  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.61 
 
 		 825 aa  158  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  30.69 
 
 		 1767 aa  155  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.34 
 
 		 810 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  29.02 
 
 		 1589 aa  154  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.07 
 
 		 816 aa  153  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  28.38 
 
 		 2189 aa  152  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.83 
 
 		 811 aa  152  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  28.9 
 
 		 1942 aa  151  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.92 
 
 		 1004 aa  150  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.92 
 
 		 811 aa  150  8e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  26.35 
 
 		 1465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  28.47 
 
 		 1770 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.64 
 
 		 820 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  29.06 
 
 		 2157 aa  147  6e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  28.81 
 
 		 903 aa  147  9e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0473362 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  26.98 
 
 		 901 aa  146  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  26.32 
 
 		 904 aa  146  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.97 
 
 		 1004 aa  147  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.83 
 
 		 688 aa  144  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 811 aa  144  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  30.26 
 
 		 402 aa  144  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05514  DEAD/DEAH box DNA helicase (Mer3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13080)  28.83 
 
 		 1385 aa  143  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451829  normal  0.647308 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.61 
 
 		 952 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  28.63 
 
 		 967 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  28.63 
 
 		 967 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  26.41 
 
 		 909 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.15 
 
 		 727 aa  139  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.82 
 
 		 996 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.2 
 
 		 762 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.81 
 
 		 667 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  26.65 
 
 		 918 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  26.84 
 
 		 919 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  26.41 
 
 		 916 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  28.22 
 
 		 905 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  24.38 
 
 		 924 aa  134  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.61 
 
 		 684 aa  134  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.66 
 
 		 695 aa  134  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  26.28 
 
 		 890 aa  134  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  27.84 
 
 		 924 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  23.37 
 
 		 935 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  23.74 
 
 		 952 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  25.97 
 
 		 889 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  26.45 
 
 		 936 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  27.03 
 
 		 908 aa  132  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  26.59 
 
 		 908 aa  132  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  28.89 
 
 		 893 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  27.09 
 
 		 1165 aa  130  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1952  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.29 
 
 		 699 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  27.71 
 
 		 906 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.48 
 
 		 922 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  26.44 
 
 		 908 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  26.55 
 
 		 926 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  27.8 
 
 		 908 aa  127  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>