More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3508 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  100 
 
 		 729 aa  1492    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  58.1 
 
 		 760 aa  872    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  48.58 
 
 		 693 aa  679    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  51.82 
 
 		 712 aa  690    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  48.77 
 
 		 723 aa  678    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  48.6 
 
 		 799 aa  634  1e-180  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  48.07 
 
 		 726 aa  635  1e-180  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  49.08 
 
 		 727 aa  627  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.42 
 
 		 791 aa  618  1e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.25 
 
 		 799 aa  604  1.0000000000000001e-171  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  44.47 
 
 		 808 aa  590  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.42 
 
 		 739 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.11 
 
 		 756 aa  499  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  52.5 
 
 		 824 aa  501  1e-140  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.87 
 
 		 747 aa  478  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.41 
 
 		 709 aa  476  1e-133  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.7 
 
 		 706 aa  476  1e-133  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.27 
 
 		 746 aa  474  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.44 
 
 		 694 aa  474  1e-132  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.62 
 
 		 747 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.17 
 
 		 707 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.74 
 
 		 707 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.46 
 
 		 707 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.68 
 
 		 751 aa  458  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.66 
 
 		 710 aa  456  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.94 
 
 		 715 aa  451  1e-125  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.96 
 
 		 708 aa  450  1e-125  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.58 
 
 		 729 aa  445  1e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.73 
 
 		 662 aa  445  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.31 
 
 		 700 aa  389  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.14 
 
 		 988 aa  336  9e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.69 
 
 		 780 aa  265  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.29 
 
 		 803 aa  259  9e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.18 
 
 		 1265 aa  259  1e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.38 
 
 		 785 aa  258  4e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.32 
 
 		 800 aa  248  4e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.63 
 
 		 807 aa  243  9e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.55 
 
 		 1004 aa  206  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.04 
 
 		 820 aa  194  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  32.18 
 
 		 1767 aa  190  7e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  29.22 
 
 		 874 aa  185  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.45 
 
 		 1004 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  34.06 
 
 		 825 aa  177  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  35.26 
 
 		 402 aa  177  9e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.77 
 
 		 825 aa  172  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.71 
 
 		 1318 aa  172  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.05 
 
 		 1230 aa  170  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 695 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  33.25 
 
 		 903 aa  162  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  27.54 
 
 		 1942 aa  162  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  30.95 
 
 		 2111 aa  162  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.83 
 
 		 816 aa  160  9e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.43 
 
 		 667 aa  160  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.73 
 
 		 811 aa  160  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.25 
 
 		 811 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  27.97 
 
 		 1465 aa  159  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.52 
 
 		 952 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.49 
 
 		 810 aa  156  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  28.01 
 
 		 901 aa  155  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  27.88 
 
 		 1060 aa  155  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2503  DEAD/DEAH box helicase-like  32.1 
 
 		 701 aa  154  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222742  normal  0.294558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  29.46 
 
 		 905 aa  154  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.3 
 
 		 817 aa  153  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  27.96 
 
 		 2208 aa  153  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  31.86 
 
 		 927 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  32.21 
 
 		 2152 aa  151  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  31.13 
 
 		 927 aa  150  9e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  26.36 
 
 		 2015 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.83 
 
 		 669 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  29.71 
 
 		 2157 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  27.8 
 
 		 1055 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.5 
 
 		 811 aa  148  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  30.16 
 
 		 893 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  30.88 
 
 		 926 aa  147  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  30.07 
 
 		 890 aa  147  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  30.73 
 
 		 908 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  30.35 
 
 		 1165 aa  145  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  30.32 
 
 		 933 aa  144  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  29.27 
 
 		 908 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  29.09 
 
 		 1173 aa  142  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.31 
 
 		 1166 aa  142  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  30.66 
 
 		 924 aa  142  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  24.88 
 
 		 1589 aa  141  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  28.64 
 
 		 1173 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.43 
 
 		 1197 aa  141  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  28.78 
 
 		 908 aa  140  7e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  29.95 
 
 		 908 aa  140  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  30.02 
 
 		 924 aa  140  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  27.9 
 
 		 919 aa  140  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  26.5 
 
 		 2189 aa  140  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  30.62 
 
 		 906 aa  139  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.93 
 
 		 1085 aa  139  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  28.41 
 
 		 924 aa  137  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  28.82 
 
 		 904 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.38 
 
 		 919 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.79 
 
 		 657 aa  137  7.000000000000001e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  28.12 
 
 		 906 aa  137  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  28.81 
 
 		 998 aa  136  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  27.39 
 
 		 889 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  27.82 
 
 		 882 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>