More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2508 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  72.14 
 
 		 807 aa  1118    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  70.23 
 
 		 785 aa  1113    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  70.59 
 
 		 800 aa  1083    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  70.36 
 
 		 803 aa  1125    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 780 aa  1566    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  32.65 
 
 		 2111 aa  301  4e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  32.28 
 
 		 1767 aa  299  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  32.77 
 
 		 1770 aa  292  2e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  34.24 
 
 		 1060 aa  290  7e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.630707 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  32.87 
 
 		 2208 aa  288  2.9999999999999996e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  31.76 
 
 		 2189 aa  284  4.0000000000000003e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 		 791 aa  279  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  31.34 
 
 		 2152 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  31.85 
 
 		 2015 aa  274  6e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  31.21 
 
 		 729 aa  267  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  31.83 
 
 		 1942 aa  266  8.999999999999999e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  32.15 
 
 		 712 aa  260  6e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  31.26 
 
 		 2157 aa  259  1e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  31.33 
 
 		 1589 aa  258  3e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.82 
 
 		 799 aa  254  4.0000000000000004e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  33.57 
 
 		 1465 aa  253  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  31.98 
 
 		 726 aa  253  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  32.46 
 
 		 760 aa  250  8e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  37.59 
 
 		 824 aa  247  4.9999999999999997e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.08 
 
 		 739 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  30.59 
 
 		 723 aa  243  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  30.68 
 
 		 799 aa  243  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.04 
 
 		 706 aa  233  1e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.33 
 
 		 694 aa  231  3e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  30.66 
 
 		 693 aa  231  4e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05514  DEAD/DEAH box DNA helicase (Mer3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13080)  30.97 
 
 		 1385 aa  226  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451829  normal  0.647308 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  34.33 
 
 		 808 aa  223  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.47 
 
 		 707 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.12 
 
 		 707 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.1 
 
 		 729 aa  219  2e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.65 
 
 		 710 aa  218  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  29.63 
 
 		 1710 aa  218  4e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.03 
 
 		 756 aa  216  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.94 
 
 		 707 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  29.55 
 
 		 727 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.27 
 
 		 747 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.41 
 
 		 709 aa  213  1e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.06 
 
 		 708 aa  212  2e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34 
 
 		 662 aa  212  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.13 
 
 		 747 aa  211  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.04 
 
 		 746 aa  209  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.69 
 
 		 700 aa  204  7e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.07 
 
 		 715 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.02 
 
 		 751 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.4 
 
 		 1230 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.43 
 
 		 1318 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  30.15 
 
 		 874 aa  173  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.92 
 
 		 988 aa  147  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  30.53 
 
 		 889 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.86 
 
 		 1265 aa  140  7e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  27.31 
 
 		 901 aa  136  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.95 
 
 		 927 aa  134  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  29.74 
 
 		 927 aa  134  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  28.35 
 
 		 926 aa  133  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  29.17 
 
 		 1055 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  28.64 
 
 		 924 aa  132  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  28.32 
 
 		 919 aa  132  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  28.48 
 
 		 893 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  27.59 
 
 		 924 aa  132  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  29.27 
 
 		 905 aa  131  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  27.34 
 
 		 872 aa  127  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  28.07 
 
 		 924 aa  127  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  30.34 
 
 		 918 aa  127  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  27.9 
 
 		 908 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.98 
 
 		 996 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  27.65 
 
 		 908 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  29.46 
 
 		 890 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  29.72 
 
 		 904 aa  126  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  27.94 
 
 		 908 aa  126  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.18 
 
 		 820 aa  126  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  28.61 
 
 		 908 aa  126  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.21 
 
 		 815 aa  124  8e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  29.43 
 
 		 906 aa  124  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.03 
 
 		 843 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.32 
 
 		 708 aa  120  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  29.43 
 
 		 825 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.47 
 
 		 762 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.83 
 
 		 657 aa  119  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  27.38 
 
 		 998 aa  119  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.38 
 
 		 917 aa  119  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.48 
 
 		 811 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.54 
 
 		 952 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  28.26 
 
 		 402 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.2 
 
 		 845 aa  116  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.74 
 
 		 816 aa  115  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.13 
 
 		 817 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.68 
 
 		 919 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.6 
 
 		 929 aa  114  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.87 
 
 		 810 aa  114  9e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  28.95 
 
 		 1173 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.33 
 
 		 825 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.03 
 
 		 811 aa  112  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.36 
 
 		 1197 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.08 
 
 		 1166 aa  109  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.65 
 
 		 669 aa  109  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>