More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0030 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  73.97 
 
 
747 aa  1151    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  74.87 
 
 
747 aa  1162    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  74.24 
 
 
746 aa  1156    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.33 
 
 
707 aa  737    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.54 
 
 
707 aa  731    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.73 
 
 
707 aa  738    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
751 aa  1512    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.38 
 
 
791 aa  492  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  39.68 
 
 
729 aa  478  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.47 
 
 
1265 aa  476  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  36.86 
 
 
723 aa  473  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  37.45 
 
 
712 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.34 
 
 
799 aa  468  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  37.15 
 
 
693 aa  463  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  37.05 
 
 
726 aa  464  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  36.85 
 
 
760 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  34.46 
 
 
824 aa  450  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  33.67 
 
 
808 aa  437  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  35.51 
 
 
799 aa  437  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  36.13 
 
 
727 aa  439  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.63 
 
 
756 aa  430  1e-119  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.68 
 
 
739 aa  419  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.13 
 
 
694 aa  421  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.39 
 
 
706 aa  395  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.83 
 
 
715 aa  383  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.38 
 
 
710 aa  384  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.54 
 
 
708 aa  380  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.69 
 
 
709 aa  377  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.91 
 
 
662 aa  372  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.91 
 
 
700 aa  368  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.49 
 
 
729 aa  360  7e-98  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.3 
 
 
988 aa  258  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  25.81 
 
 
874 aa  213  7.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.43 
 
 
780 aa  210  8e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.06 
 
 
785 aa  205  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.31 
 
 
803 aa  205  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.07 
 
 
807 aa  191  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.72 
 
 
800 aa  190  8e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  28.14 
 
 
1060 aa  172  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.630707 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  32.05 
 
 
2208 aa  171  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  26.19 
 
 
2189 aa  166  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.99 
 
 
1230 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.92 
 
 
1318 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  27.07 
 
 
2152 aa  162  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.95 
 
 
825 aa  162  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  30.09 
 
 
2111 aa  162  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.9 
 
 
1004 aa  160  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  29.16 
 
 
1710 aa  159  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  25.8 
 
 
1770 aa  158  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  29.57 
 
 
903 aa  157  9e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  26.74 
 
 
1767 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  26.43 
 
 
1465 aa  153  8.999999999999999e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  30.13 
 
 
825 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32 
 
 
811 aa  152  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  25.57 
 
 
904 aa  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.73 
 
 
1004 aa  151  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  27.08 
 
 
2157 aa  150  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  28.37 
 
 
1589 aa  150  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05514  DEAD/DEAH box DNA helicase (Mer3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13080)  30.03 
 
 
1385 aa  150  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451829  normal  0.647308 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  27.43 
 
 
2015 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  26.97 
 
 
1942 aa  149  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  31.33 
 
 
402 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.43 
 
 
811 aa  148  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  25.57 
 
 
1055 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  26.48 
 
 
901 aa  147  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.63 
 
 
810 aa  146  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.95 
 
 
820 aa  145  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.16 
 
 
688 aa  144  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  26.92 
 
 
889 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  24.61 
 
 
952 aa  144  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.2 
 
 
816 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  26.46 
 
 
918 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.74 
 
 
811 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  27.22 
 
 
908 aa  141  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.8 
 
 
667 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.71 
 
 
727 aa  140  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.24 
 
 
684 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  26.2 
 
 
909 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  27.33 
 
 
908 aa  139  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.51 
 
 
762 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  25.97 
 
 
916 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  26.54 
 
 
936 aa  138  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  27 
 
 
908 aa  138  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.69 
 
 
932 aa  137  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  28.03 
 
 
890 aa  137  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.54 
 
 
952 aa  137  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2256  DSH domain-containing protein  26.4 
 
 
935 aa  137  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.47 
 
 
669 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.82 
 
 
918 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  25.45 
 
 
924 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.82 
 
 
918 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.82 
 
 
918 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  26.16 
 
 
906 aa  135  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  29.4 
 
 
908 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.68 
 
 
695 aa  135  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  28.57 
 
 
905 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  28 
 
 
1173 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  25.33 
 
 
924 aa  134  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.17 
 
 
922 aa  134  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.983336  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.68 
 
 
927 aa  134  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>