More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1232 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  45.5 
 
 		 825 aa  717    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.34 
 
 		 825 aa  674    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 820 aa  1652    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.14 
 
 		 684 aa  502  1e-140  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.99 
 
 		 688 aa  499  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1952  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.92 
 
 		 699 aa  501  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.21 
 
 		 727 aa  493  9.999999999999999e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.75 
 
 		 697 aa  482  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.061394 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  42.77 
 
 		 903 aa  478  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.47 
 
 		 669 aa  477  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.2 
 
 		 810 aa  474  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.01 
 
 		 695 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.54 
 
 		 667 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.01 
 
 		 816 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.19 
 
 		 811 aa  465  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.66 
 
 		 811 aa  465  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2503  DEAD/DEAH box helicase-like  42.96 
 
 		 701 aa  452  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222742  normal  0.294558 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.54 
 
 		 811 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.52 
 
 		 706 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  29.85 
 
 		 729 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  31.52 
 
 		 712 aa  189  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.44 
 
 		 708 aa  189  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.91 
 
 		 756 aa  184  8.000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  29.41 
 
 		 726 aa  183  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  29.04 
 
 		 693 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.6 
 
 		 715 aa  180  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  32.83 
 
 		 723 aa  180  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.46 
 
 		 710 aa  178  3e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  30.04 
 
 		 799 aa  177  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.39 
 
 		 729 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  30.3 
 
 		 760 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  29.19 
 
 		 727 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  29.12 
 
 		 824 aa  175  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.96 
 
 		 791 aa  159  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  27.75 
 
 		 808 aa  159  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.82 
 
 		 709 aa  159  3e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.08 
 
 		 799 aa  157  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.91 
 
 		 694 aa  157  7e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.85 
 
 		 739 aa  152  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.21 
 
 		 746 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.55 
 
 		 747 aa  149  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.31 
 
 		 747 aa  147  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.99 
 
 		 751 aa  145  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.33 
 
 		 707 aa  144  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.78 
 
 		 707 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.12 
 
 		 700 aa  140  8.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.32 
 
 		 707 aa  140  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.09 
 
 		 662 aa  130  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.7 
 
 		 780 aa  126  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.56 
 
 		 1004 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.99 
 
 		 657 aa  122  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1802  helicase  38.1 
 
 		 151 aa  121  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.89 
 
 		 1230 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  25.61 
 
 		 1767 aa  119  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.81 
 
 		 807 aa  119  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.87 
 
 		 800 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.67 
 
 		 785 aa  116  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.91 
 
 		 988 aa  114  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  26.32 
 
 		 874 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.3 
 
 		 803 aa  112  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  27.35 
 
 		 893 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  23.99 
 
 		 901 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.98 
 
 		 1004 aa  108  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.12 
 
 		 1265 aa  107  7e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2232  helicase  36.55 
 
 		 151 aa  107  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0453  Superfamily II helicase-like protein  35.17 
 
 		 151 aa  107  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.24 
 
 		 1318 aa  106  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28 
 
 		 817 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1030  helicase  35.92 
 
 		 150 aa  104  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0483142 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  25.12 
 
 		 1465 aa  102  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.07 
 
 		 708 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1610  superfamily II helicase-like protein  38.03 
 
 		 150 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182586  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  24.72 
 
 		 2015 aa  102  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.34 
 
 		 847 aa  102  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1633  helicase  36.23 
 
 		 150 aa  101  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.53 
 
 		 837 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.39 
 
 		 845 aa  99.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  25.92 
 
 		 2111 aa  99.8  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.1 
 
 		 928 aa  99  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.3 
 
 		 937 aa  98.6  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.31 
 
 		 762 aa  97.4  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  25.87 
 
 		 924 aa  96.3  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  23.3 
 
 		 1068 aa  95.9  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  24.4 
 
 		 908 aa  95.9  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05480  superfamily II RNA helicase  27.64 
 
 		 842 aa  94  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5274  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.78 
 
 		 827 aa  94  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.27 
 
 		 706 aa  93.6  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.46 
 
 		 916 aa  94  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2260  DEAD/DEAH box helicase-like  28.49 
 
 		 885 aa  92.8  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  25.97 
 
 		 898 aa  92.8  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2133  superfamily II helicase-like protein  35.16 
 
 		 150 aa  92.4  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.273183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  26.33 
 
 		 926 aa  92  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.43 
 
 		 890 aa  92  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  27.05 
 
 		 842 aa  92  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.32 
 
 		 851 aa  91.7  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.07 
 
 		 928 aa  91.7  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  26.63 
 
 		 855 aa  91.3  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.94 
 
 		 927 aa  90.5  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.79 
 
 		 1122 aa  90.5  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.84 
 
 		 932 aa  90.5  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>