17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1030 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1030  helicase  100 
 
 
150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0483142 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1633  helicase  80 
 
 
150 aa  253  6e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1802  helicase  73.83 
 
 
151 aa  238  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0453  Superfamily II helicase-like protein  75.68 
 
 
151 aa  234  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2232  helicase  76.87 
 
 
151 aa  234  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.57 
 
 
825 aa  134  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  43.48 
 
 
825 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.92 
 
 
820 aa  104  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0067  superfamily II helicase-like protein  36.57 
 
 
157 aa  103  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0705682 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2133  superfamily II helicase-like protein  36.43 
 
 
150 aa  100  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.273183  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1263  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1610  superfamily II helicase-like protein  35.21 
 
 
150 aa  94.7  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182586  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1054  superfamily II helicase-like protein  38.71 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0603632  normal  0.118823 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.21 
 
 
816 aa  50.4  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.18 
 
 
810 aa  40.8  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
811 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.27 
 
 
811 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>