16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1802 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1802  helicase  100 
 
 
151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1030  helicase  73.83 
 
 
150 aa  238  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0483142 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2232  helicase  74 
 
 
151 aa  235  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0453  Superfamily II helicase-like protein  72 
 
 
151 aa  231  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1633  helicase  69.8 
 
 
150 aa  223  9e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  43.05 
 
 
825 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.41 
 
 
825 aa  131  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.1 
 
 
820 aa  121  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0067  superfamily II helicase-like protein  36.43 
 
 
157 aa  102  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0705682 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1263  hypothetical protein  37.4 
 
 
150 aa  101  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1610  superfamily II helicase-like protein  34.53 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182586  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2133  superfamily II helicase-like protein  35.71 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.273183  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1054  superfamily II helicase-like protein  35.83 
 
 
150 aa  94.4  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0603632  normal  0.118823 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.8 
 
 
816 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.93 
 
 
811 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.3 
 
 
811 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>