14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1054 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1054  superfamily II helicase-like protein  100 
 
 
150 aa  305  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0603632  normal  0.118823 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1263  hypothetical protein  59.33 
 
 
150 aa  188  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1610  superfamily II helicase-like protein  58.39 
 
 
150 aa  184  5e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182586  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2133  superfamily II helicase-like protein  56.67 
 
 
150 aa  179  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.273183  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0067  superfamily II helicase-like protein  52 
 
 
157 aa  163  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0705682 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.51 
 
 
825 aa  107  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0453  Superfamily II helicase-like protein  34.48 
 
 
151 aa  100  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  34.59 
 
 
825 aa  97.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2232  helicase  34.48 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1802  helicase  35.83 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1633  helicase  37.07 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1030  helicase  38.71 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0483142 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.68 
 
 
820 aa  88.2  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.2 
 
 
816 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>