More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3595 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 		 825 aa  1701    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  59.34 
 
 		 825 aa  1039    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.5 
 
 		 820 aa  706    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.37 
 
 		 688 aa  558  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.22 
 
 		 727 aa  548  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.18 
 
 		 684 aa  536  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.1 
 
 		 695 aa  530  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.91 
 
 		 667 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.41 
 
 		 697 aa  524  1e-147  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.061394 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  44.65 
 
 		 903 aa  523  1e-147  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1952  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.67 
 
 		 699 aa  520  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.74 
 
 		 669 aa  521  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.17 
 
 		 816 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2503  DEAD/DEAH box helicase-like  41.78 
 
 		 701 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222742  normal  0.294558 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.81 
 
 		 811 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.88 
 
 		 811 aa  458  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.05 
 
 		 811 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.98 
 
 		 810 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  34.78 
 
 		 723 aa  184  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  36.94 
 
 		 760 aa  180  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  29.11 
 
 		 726 aa  179  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  30.04 
 
 		 799 aa  177  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  34.22 
 
 		 712 aa  177  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  34.06 
 
 		 729 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  32.75 
 
 		 727 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.18 
 
 		 709 aa  175  3.9999999999999995e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.76 
 
 		 756 aa  172  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  32.72 
 
 		 693 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.42 
 
 		 791 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.76 
 
 		 747 aa  159  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.7 
 
 		 746 aa  159  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.66 
 
 		 799 aa  159  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.71 
 
 		 715 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.07 
 
 		 747 aa  156  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.62 
 
 		 710 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.95 
 
 		 707 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.01 
 
 		 707 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.45 
 
 		 706 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.43 
 
 		 707 aa  154  7e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  28.6 
 
 		 824 aa  153  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.06 
 
 		 729 aa  152  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.34 
 
 		 694 aa  150  7e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.13 
 
 		 751 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1802  helicase  43.05 
 
 		 151 aa  148  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  26.8 
 
 		 808 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.08 
 
 		 708 aa  147  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.28 
 
 		 739 aa  144  8e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.14 
 
 		 700 aa  140  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.14 
 
 		 657 aa  138  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1030  helicase  41.38 
 
 		 150 aa  130  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0483142 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0453  Superfamily II helicase-like protein  39.31 
 
 		 151 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.79 
 
 		 1265 aa  127  8.000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2232  helicase  39.31 
 
 		 151 aa  127  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1633  helicase  39.31 
 
 		 150 aa  124  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.45 
 
 		 662 aa  122  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.08 
 
 		 800 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.43 
 
 		 780 aa  119  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.34 
 
 		 785 aa  117  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.93 
 
 		 807 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.73 
 
 		 803 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  26.92 
 
 		 2111 aa  116  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  25.62 
 
 		 2015 aa  109  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  28.04 
 
 		 1465 aa  109  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  25.7 
 
 		 1068 aa  108  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  29.1 
 
 		 889 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.28 
 
 		 1230 aa  107  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  23.94 
 
 		 1942 aa  107  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.11 
 
 		 988 aa  106  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  28.15 
 
 		 2152 aa  105  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  26.62 
 
 		 1060 aa  105  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  27.29 
 
 		 919 aa  105  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  25.07 
 
 		 1767 aa  103  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.98 
 
 		 1318 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  25.25 
 
 		 2157 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1610  superfamily II helicase-like protein  33.33 
 
 		 150 aa  102  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182586  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 946 aa  101  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  27.01 
 
 		 905 aa  100  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.65 
 
 		 1004 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.69 
 
 		 909 aa  100  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  25.77 
 
 		 998 aa  99.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  26.14 
 
 		 906 aa  100  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.68 
 
 		 897 aa  99.4  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  28.36 
 
 		 890 aa  99  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.12 
 
 		 711 aa  98.6  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  24.69 
 
 		 874 aa  98.2  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.04 
 
 		 927 aa  97.8  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.49 
 
 		 927 aa  98.2  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  28.04 
 
 		 927 aa  98.2  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  24.71 
 
 		 1710 aa  97.8  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.76 
 
 		 845 aa  97.4  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  24.47 
 
 		 2208 aa  97.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  26.7 
 
 		 893 aa  97.4  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0067  superfamily II helicase-like protein  36.29 
 
 		 157 aa  97.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0705682 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1054  superfamily II helicase-like protein  34.59 
 
 		 150 aa  97.4  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0603632  normal  0.118823 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  25.91 
 
 		 926 aa  96.3  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2133  superfamily II helicase-like protein  34.06 
 
 		 150 aa  96.3  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.273183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.21 
 
 		 928 aa  95.5  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  27.02 
 
 		 898 aa  95.1  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.91 
 
 		 708 aa  95.1  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.51 
 
 		 928 aa  94.7  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>