17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1633 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1633  helicase  100 
 
 
150 aa  310  5.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1030  helicase  80 
 
 
150 aa  253  6e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0483142 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1802  helicase  69.8 
 
 
151 aa  223  9e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2232  helicase  72.48 
 
 
151 aa  221  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0453  Superfamily II helicase-like protein  70.47 
 
 
151 aa  221  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.16 
 
 
825 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  41.3 
 
 
825 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.23 
 
 
820 aa  101  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2133  superfamily II helicase-like protein  37.14 
 
 
150 aa  100  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.273183  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1263  hypothetical protein  41.03 
 
 
150 aa  97.4  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1610  superfamily II helicase-like protein  35.71 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182586  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0067  superfamily II helicase-like protein  34.11 
 
 
157 aa  92  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0705682 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1054  superfamily II helicase-like protein  37.07 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0603632  normal  0.118823 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.56 
 
 
816 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.7 
 
 
811 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.83 
 
 
811 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.57 
 
 
810 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>