More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI00970 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  100 
 
 		 1465 aa  3049    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05514  DEAD/DEAH box DNA helicase (Mer3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13080)  30.52 
 
 		 1385 aa  354  8.999999999999999e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451829  normal  0.647308 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  28.48 
 
 		 1710 aa  311  5.9999999999999995e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  34.04 
 
 		 1060 aa  308  5.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  28.64 
 
 		 2157 aa  263  3e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  30.91 
 
 		 1589 aa  259  2e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  31.66 
 
 		 1942 aa  259  3e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  34.15 
 
 		 2111 aa  255  5.000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.57 
 
 		 780 aa  253  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  32.48 
 
 		 1767 aa  253  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.85 
 
 		 803 aa  251  8e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  32.12 
 
 		 2015 aa  251  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  29.18 
 
 		 2208 aa  249  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  28.26 
 
 		 2152 aa  246  3e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  31.14 
 
 		 1770 aa  243  1e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  27.2 
 
 		 2189 aa  240  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.51 
 
 		 785 aa  234  8.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.69 
 
 		 807 aa  234  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.63 
 
 		 800 aa  229  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.63 
 
 		 694 aa  160  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  27.97 
 
 		 729 aa  159  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.33 
 
 		 791 aa  155  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.1 
 
 		 747 aa  152  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.5 
 
 		 746 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.88 
 
 		 709 aa  150  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.2 
 
 		 1318 aa  149  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.43 
 
 		 751 aa  148  7.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.27 
 
 		 707 aa  148  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  27.53 
 
 		 824 aa  147  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.67 
 
 		 747 aa  145  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.05 
 
 		 1230 aa  144  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  26.6 
 
 		 808 aa  143  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.5 
 
 		 739 aa  143  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.54 
 
 		 707 aa  143  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.75 
 
 		 707 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.14 
 
 		 700 aa  142  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  27.34 
 
 		 726 aa  141  8.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  30.29 
 
 		 712 aa  141  8.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.05 
 
 		 706 aa  140  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28 
 
 		 708 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.84 
 
 		 715 aa  138  8e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  27.75 
 
 		 760 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.78 
 
 		 756 aa  136  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  27.79 
 
 		 693 aa  136  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  27.5 
 
 		 723 aa  133  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.56 
 
 		 729 aa  131  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.55 
 
 		 710 aa  129  5e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  27.49 
 
 		 874 aa  126  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  23.6 
 
 		 901 aa  119  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  26.08 
 
 		 1165 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.98 
 
 		 1166 aa  115  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.34 
 
 		 657 aa  114  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.95 
 
 		 1004 aa  114  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  26.64 
 
 		 908 aa  113  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.53 
 
 		 1265 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  26.48 
 
 		 1068 aa  112  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2656  DSH domain-containing protein  28.27 
 
 		 936 aa  110  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  26.86 
 
 		 908 aa  110  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  27.13 
 
 		 863 aa  110  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  27.21 
 
 		 927 aa  109  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  28.04 
 
 		 825 aa  109  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.32 
 
 		 1197 aa  109  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  29.38 
 
 		 1055 aa  108  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.76 
 
 		 927 aa  108  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  24.64 
 
 		 1068 aa  108  9e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.73 
 
 		 1054 aa  107  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  27.73 
 
 		 1054 aa  107  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  25.98 
 
 		 908 aa  106  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  27.07 
 
 		 926 aa  106  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29 
 
 		 952 aa  106  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  26.28 
 
 		 924 aa  105  7e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  28.27 
 
 		 727 aa  105  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.06 
 
 		 825 aa  103  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  26.57 
 
 		 918 aa  103  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  26.98 
 
 		 998 aa  103  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  27.92 
 
 		 924 aa  103  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  25.83 
 
 		 924 aa  103  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  27.75 
 
 		 904 aa  103  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.96 
 
 		 932 aa  103  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.891699  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2692  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.05 
 
 		 951 aa  103  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517948  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.42 
 
 		 811 aa  102  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.43 
 
 		 810 aa  102  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  28.05 
 
 		 882 aa  102  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.12 
 
 		 820 aa  102  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  25.31 
 
 		 903 aa  102  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  26.39 
 
 		 1173 aa  101  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  27.41 
 
 		 889 aa  101  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1292  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.91 
 
 		 950 aa  101  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.459724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.27 
 
 		 845 aa  101  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  25.35 
 
 		 872 aa  100  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.42 
 
 		 811 aa  100  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  26.46 
 
 		 908 aa  100  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  26.65 
 
 		 1173 aa  99.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.08 
 
 		 921 aa  98.6  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.215592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  26.29 
 
 		 841 aa  98.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.69 
 
 		 1085 aa  96.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2321  DSH domain protein  27.86 
 
 		 916 aa  96.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000521506  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.02 
 
 		 762 aa  96.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.59 
 
 		 917 aa  96.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3440  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.74 
 
 		 929 aa  96.3  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>