More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1378 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
657 aa  1338    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.03 
 
 
706 aa  159  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  33.6 
 
 
726 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  26.17 
 
 
723 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  31.44 
 
 
712 aa  148  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.56 
 
 
739 aa  145  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.86 
 
 
708 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  30.85 
 
 
727 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.89 
 
 
700 aa  141  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.27 
 
 
715 aa  139  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.98 
 
 
694 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  29.14 
 
 
825 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  30 
 
 
799 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  27.79 
 
 
729 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  28.69 
 
 
693 aa  134  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.74 
 
 
710 aa  133  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.9 
 
 
825 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  29.79 
 
 
824 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.41 
 
 
756 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.45 
 
 
807 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.84 
 
 
662 aa  126  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.58 
 
 
746 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.35 
 
 
747 aa  127  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.2 
 
 
709 aa  126  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.27 
 
 
729 aa  124  4e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.41 
 
 
751 aa  124  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.58 
 
 
811 aa  124  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.55 
 
 
800 aa  124  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.8 
 
 
747 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.76 
 
 
707 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.33 
 
 
707 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.76 
 
 
707 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.72 
 
 
791 aa  120  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  29.66 
 
 
760 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.83 
 
 
780 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.65 
 
 
820 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.76 
 
 
811 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  29.4 
 
 
1767 aa  115  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.65 
 
 
816 aa  115  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.6 
 
 
695 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  26.34 
 
 
1465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.5 
 
 
688 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.18 
 
 
785 aa  113  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.19 
 
 
811 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.08 
 
 
803 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.91 
 
 
667 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.86 
 
 
810 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.62 
 
 
799 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  28.5 
 
 
808 aa  108  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  27.43 
 
 
2157 aa  108  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  27.9 
 
 
1060 aa  107  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  28.57 
 
 
2152 aa  107  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  28.15 
 
 
2111 aa  106  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  27.75 
 
 
903 aa  106  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.67 
 
 
684 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  28.07 
 
 
2015 aa  102  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  25.78 
 
 
2189 aa  102  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.93 
 
 
669 aa  100  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  25.19 
 
 
1942 aa  99.8  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.16 
 
 
727 aa  99.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  26.1 
 
 
2208 aa  98.2  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  25.87 
 
 
1589 aa  97.4  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1952  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.68 
 
 
699 aa  95.5  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  26.05 
 
 
1710 aa  93.2  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  27.43 
 
 
1165 aa  93.2  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.75 
 
 
1004 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.08 
 
 
952 aa  92.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  25.39 
 
 
1770 aa  92  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.93 
 
 
697 aa  91.3  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.061394 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  23.26 
 
 
646 aa  89.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.4 
 
 
1265 aa  88.6  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  24.9 
 
 
955 aa  88.2  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  26.63 
 
 
1173 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.98 
 
 
1166 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2503  DEAD/DEAH box helicase-like  25.28 
 
 
701 aa  85.9  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222742  normal  0.294558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.1 
 
 
817 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  26.49 
 
 
889 aa  84.7  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  24.2 
 
 
882 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  24.48 
 
 
901 aa  83.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  25.37 
 
 
924 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  26.54 
 
 
1173 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  25.13 
 
 
908 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.94 
 
 
762 aa  82  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  24.88 
 
 
908 aa  80.9  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2377  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.7 
 
 
662 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0320482  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  25.19 
 
 
893 aa  80.5  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  25.5 
 
 
927 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  25.42 
 
 
908 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.88 
 
 
1197 aa  80.1  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1075  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  29.05 
 
 
632 aa  79.7  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035291 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  25.93 
 
 
927 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.95 
 
 
996 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.02 
 
 
845 aa  79  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2228  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.53 
 
 
588 aa  78.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.63346  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  24.65 
 
 
906 aa  79  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  23.74 
 
 
874 aa  78.2  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  24.94 
 
 
872 aa  78.2  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  25.06 
 
 
908 aa  78.2  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.27 
 
 
837 aa  77.4  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  28.07 
 
 
710 aa  77.4  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.417145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>