More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0529 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  96.18 
 
 		 811 aa  1585    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  96.42 
 
 		 811 aa  1563    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.36 
 
 		 816 aa  1072    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 811 aa  1642    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  84.09 
 
 		 810 aa  1409    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  34.78 
 
 		 825 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.19 
 
 		 820 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.86 
 
 		 825 aa  443  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.48 
 
 		 688 aa  405  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.34 
 
 		 727 aa  400  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.67 
 
 		 684 aa  399  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.95 
 
 		 697 aa  397  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.061394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1952  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.38 
 
 		 699 aa  394  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.98 
 
 		 667 aa  373  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 		 669 aa  375  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.92 
 
 		 695 aa  369  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  39.47 
 
 		 903 aa  369  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2503  DEAD/DEAH box helicase-like  36.5 
 
 		 701 aa  351  3e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222742  normal  0.294558 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.69 
 
 		 715 aa  180  8e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.09 
 
 		 756 aa  176  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  32.6 
 
 		 723 aa  170  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.63 
 
 		 706 aa  168  4e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  28.79 
 
 		 726 aa  168  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  30.43 
 
 		 727 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  31.31 
 
 		 760 aa  162  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.52 
 
 		 709 aa  162  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  28.73 
 
 		 729 aa  160  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.04 
 
 		 707 aa  160  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  27.9 
 
 		 712 aa  158  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.59 
 
 		 747 aa  158  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33 
 
 		 747 aa  158  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.81 
 
 		 707 aa  158  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  29.81 
 
 		 824 aa  157  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.42 
 
 		 710 aa  154  7e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.83 
 
 		 746 aa  152  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.51 
 
 		 729 aa  152  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.89 
 
 		 707 aa  150  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  26.36 
 
 		 799 aa  150  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  29.56 
 
 		 693 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32 
 
 		 751 aa  147  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.41 
 
 		 708 aa  146  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.67 
 
 		 791 aa  143  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.3 
 
 		 662 aa  141  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.12 
 
 		 799 aa  141  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  26.09 
 
 		 808 aa  141  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.6 
 
 		 1265 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.68 
 
 		 700 aa  132  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.06 
 
 		 694 aa  123  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.21 
 
 		 807 aa  123  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.87 
 
 		 988 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.39 
 
 		 739 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.76 
 
 		 657 aa  119  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.12 
 
 		 800 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.61 
 
 		 780 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  26.65 
 
 		 889 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.39 
 
 		 803 aa  111  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  27.92 
 
 		 898 aa  109  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.8 
 
 		 785 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  24.52 
 
 		 874 aa  108  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  27.85 
 
 		 893 aa  107  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.9 
 
 		 1318 aa  107  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.95 
 
 		 1230 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  25.84 
 
 		 2015 aa  106  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  27.76 
 
 		 908 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  26.42 
 
 		 1465 aa  102  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  23.91 
 
 		 2189 aa  102  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.78 
 
 		 897 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.67 
 
 		 909 aa  99.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  25.69 
 
 		 924 aa  99  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.74 
 
 		 928 aa  98.6  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  24.74 
 
 		 402 aa  98.2  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  25.64 
 
 		 2208 aa  97.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.58 
 
 		 927 aa  97.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  26.58 
 
 		 927 aa  97.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  22.81 
 
 		 2152 aa  96.3  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.08 
 
 		 932 aa  95.5  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.86 
 
 		 903 aa  95.5  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.86 
 
 		 928 aa  95.1  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  25.7 
 
 		 1767 aa  94.4  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.62 
 
 		 708 aa  94.4  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.32 
 
 		 927 aa  94.4  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.71 
 
 		 762 aa  94.4  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.72 
 
 		 937 aa  93.6  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.86 
 
 		 716 aa  93.2  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.2 
 
 		 1004 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.09 
 
 		 926 aa  92.8  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  23.81 
 
 		 1942 aa  93.2  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  26.89 
 
 		 1060 aa  93.2  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  24.28 
 
 		 2111 aa  91.7  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.93 
 
 		 916 aa  91.7  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.82 
 
 		 845 aa  90.9  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.75 
 
 		 1004 aa  89  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  28.17 
 
 		 710 aa  87.8  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  25.14 
 
 		 711 aa  87  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.49 
 
 		 946 aa  87  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  25.82 
 
 		 872 aa  86.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  30.15 
 
 		 1026 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  24.88 
 
 		 1710 aa  85.1  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0221  helicase domain protein  26.46 
 
 		 548 aa  84.7  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.447634  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.81 
 
 		 817 aa  84.7  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>