More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43137 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  100 
 
 
402 aa  814    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  35.19 
 
 
874 aa  213  7e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  33.41 
 
 
901 aa  199  7.999999999999999e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  35.26 
 
 
729 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  35.22 
 
 
712 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
756 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  32.75 
 
 
726 aa  167  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  33.58 
 
 
760 aa  163  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  32.59 
 
 
693 aa  162  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  31.51 
 
 
723 aa  159  9e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  30.17 
 
 
727 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  32.66 
 
 
799 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.39 
 
 
747 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.67 
 
 
747 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.26 
 
 
746 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.76 
 
 
799 aa  142  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  33.5 
 
 
824 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.9 
 
 
715 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.92 
 
 
706 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.2 
 
 
791 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.17 
 
 
709 aa  139  6e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  28.74 
 
 
808 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.08 
 
 
751 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.06 
 
 
707 aa  136  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.51 
 
 
739 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.29 
 
 
707 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.51 
 
 
707 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.68 
 
 
700 aa  127  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.35 
 
 
729 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.14 
 
 
710 aa  123  5e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.03 
 
 
708 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.99 
 
 
694 aa  121  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.3 
 
 
662 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  29.76 
 
 
2208 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.26 
 
 
780 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.98 
 
 
1004 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.16 
 
 
800 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.06 
 
 
1265 aa  113  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.88 
 
 
807 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  28.41 
 
 
1710 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.76 
 
 
1004 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  28.29 
 
 
1060 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.2 
 
 
803 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  28.78 
 
 
2157 aa  106  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  25.83 
 
 
2152 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  28.07 
 
 
889 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  26.81 
 
 
2189 aa  102  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  27.53 
 
 
2015 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.94 
 
 
816 aa  101  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  25.98 
 
 
1942 aa  101  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.1 
 
 
1230 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.88 
 
 
785 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  27.55 
 
 
1770 aa  99.4  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  26.76 
 
 
2111 aa  99  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.74 
 
 
811 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.12 
 
 
811 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25 
 
 
825 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.64 
 
 
817 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.2 
 
 
1318 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  26.39 
 
 
908 aa  93.2  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  26.51 
 
 
924 aa  92.8  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  27.85 
 
 
1767 aa  92.8  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  26.62 
 
 
926 aa  92.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  24.55 
 
 
1073 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0947  hypothetical protein  24.65 
 
 
1051 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0339095  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  25.23 
 
 
908 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  25.47 
 
 
927 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  25.29 
 
 
924 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  25.47 
 
 
927 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  28.1 
 
 
893 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  25 
 
 
998 aa  90.1  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  25.23 
 
 
908 aa  90.1  7e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.04 
 
 
811 aa  89.7  8e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  26.59 
 
 
924 aa  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  24.94 
 
 
908 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.67 
 
 
810 aa  89  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  27.18 
 
 
890 aa  88.6  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  27.45 
 
 
909 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  26.62 
 
 
904 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.88 
 
 
762 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  26.06 
 
 
905 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.58 
 
 
820 aa  86.7  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  24.94 
 
 
1589 aa  86.7  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  25.36 
 
 
1173 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.71 
 
 
709 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  27.4 
 
 
906 aa  85.9  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  25 
 
 
1068 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  26.85 
 
 
1465 aa  84.7  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  26.83 
 
 
919 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.14 
 
 
919 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  23.48 
 
 
903 aa  84.7  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  26.23 
 
 
1055 aa  83.6  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.39 
 
 
952 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  25.56 
 
 
825 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  24.38 
 
 
1165 aa  82.8  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3383  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.94 
 
 
868 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.865687  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2503  DEAD/DEAH box helicase-like  26.52 
 
 
701 aa  82  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222742  normal  0.294558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  24.64 
 
 
1173 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  26.83 
 
 
952 aa  80.9  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.2 
 
 
845 aa  81.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>