More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1035 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  73.96 
 
 
727 aa  1027    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  73.39 
 
 
688 aa  1027    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0056  DEAD/DEAH box helicase domain protein  71.88 
 
 
684 aa  971    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.000344856 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1952  DEAD/DEAH box helicase domain protein  78.65 
 
 
699 aa  1089    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
697 aa  1420    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.061394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  44.41 
 
 
825 aa  543  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.16 
 
 
825 aa  522  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.55 
 
 
669 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1232  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.75 
 
 
820 aa  490  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1575  NADPH-dependent F420 reductase  42.42 
 
 
903 aa  491  1e-137  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0473362 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.38 
 
 
695 aa  482  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.750592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0184  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.22 
 
 
667 aa  481  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.579333  normal  0.0966259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2503  DEAD/DEAH box helicase-like  40.95 
 
 
701 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222742  normal  0.294558 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.06 
 
 
816 aa  428  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0529  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.95 
 
 
811 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0309  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.38 
 
 
811 aa  412  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.769358  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1390  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.54 
 
 
811 aa  405  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.59 
 
 
810 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  30.29 
 
 
824 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.62 
 
 
756 aa  162  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  27.64 
 
 
693 aa  159  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  29.28 
 
 
723 aa  158  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.44 
 
 
707 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.96 
 
 
791 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.52 
 
 
707 aa  150  8e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  28.28 
 
 
808 aa  150  8e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.13 
 
 
706 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  28.81 
 
 
712 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.41 
 
 
694 aa  147  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.14 
 
 
707 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  31.49 
 
 
760 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.77 
 
 
709 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.18 
 
 
739 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  28.8 
 
 
729 aa  142  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.89 
 
 
799 aa  141  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  28.28 
 
 
799 aa  140  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  27.8 
 
 
727 aa  140  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.17 
 
 
715 aa  139  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.19 
 
 
747 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.29 
 
 
710 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.55 
 
 
708 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.05 
 
 
662 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.39 
 
 
746 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.19 
 
 
747 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.32 
 
 
729 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  28.82 
 
 
726 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.9 
 
 
751 aa  130  6e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.64 
 
 
700 aa  130  8.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.54 
 
 
807 aa  114  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.97 
 
 
800 aa  111  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  25.23 
 
 
1767 aa  110  9.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.18 
 
 
780 aa  109  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.38 
 
 
1230 aa  108  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  25.68 
 
 
2015 aa  107  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  26.11 
 
 
893 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.52 
 
 
803 aa  106  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.45 
 
 
1265 aa  106  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.27 
 
 
845 aa  106  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.38 
 
 
785 aa  105  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.98 
 
 
657 aa  105  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  24.46 
 
 
1710 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.58 
 
 
988 aa  99.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.26 
 
 
1318 aa  99.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  25 
 
 
1060 aa  98.2  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  25.81 
 
 
889 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  22.83 
 
 
1589 aa  95.9  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  23.77 
 
 
2157 aa  95.1  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  23.4 
 
 
1942 aa  94.4  7e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  25.9 
 
 
1465 aa  92.8  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  25.89 
 
 
890 aa  91.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1019  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.75 
 
 
837 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  23.99 
 
 
1068 aa  91.3  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.69 
 
 
851 aa  91.3  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.247893  normal  0.727004 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  26.11 
 
 
2208 aa  90.5  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.62 
 
 
1004 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  24.17 
 
 
402 aa  89.7  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  22.48 
 
 
1770 aa  87.8  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.45 
 
 
1004 aa  87.4  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3171  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.34 
 
 
817 aa  87.8  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106755  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  24.29 
 
 
2189 aa  86.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  31.65 
 
 
953 aa  87  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  27.32 
 
 
908 aa  87  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  26.93 
 
 
2111 aa  87  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  22.4 
 
 
901 aa  86.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  26.94 
 
 
926 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  26.99 
 
 
1173 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3065  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.48 
 
 
847 aa  84.7  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.220572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2815  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.99 
 
 
837 aa  82.8  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  26.59 
 
 
919 aa  82.8  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  24.74 
 
 
852 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5350  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.74 
 
 
852 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.74 
 
 
852 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.37 
 
 
927 aa  80.5  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.91 
 
 
928 aa  80.1  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0221  helicase domain protein  26.58 
 
 
548 aa  80.1  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.447634  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  23.75 
 
 
874 aa  80.1  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.5 
 
 
928 aa  79.7  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.32 
 
 
696 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.69 
 
 
981 aa  79.3  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.37 
 
 
964 aa  79  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.510547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>