More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG03650 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG03650  ATP dependent RNA helicase, putative  100 
 
 
620 aa  1263    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.451389  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81007  predicted protein  35.98 
 
 
558 aa  300  5e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.661709  normal  0.655952 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30562  predicted protein  44.48 
 
 
474 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.387537 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32758  predicted protein  33.13 
 
 
483 aa  235  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00944  ATP-dependent RNA helicase rok1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BET6]  34.3 
 
 
742 aa  212  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.144207  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36611  predicted protein  31.86 
 
 
452 aa  184  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438813  decreased coverage  0.000242961 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27227  predicted protein  31.86 
 
 
452 aa  184  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.689197 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01240  p68-like protein, putative  30.73 
 
 
540 aa  183  7e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.87 
 
 
423 aa  182  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01266  Pre-mRNA-processing ATP-dependent RNA helicase prp5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDW4]  31 
 
 
1173 aa  180  7e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505248  normal  0.0523257 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1423  DEAD/DEAH box helicase-like  31.46 
 
 
460 aa  179  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55603  ATP-dependent RNA helicase of DEAD box family  31.81 
 
 
616 aa  176  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.19 
 
 
450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000706088  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.6 
 
 
452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00281492  normal  0.0306725 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2496  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  32.09 
 
 
450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2571  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  31.72 
 
 
454 aa  174  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2223  ATP-dependent RNA helicase  32.09 
 
 
450 aa  174  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2269  ATP-dependent RNA helicase  32.09 
 
 
450 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0874  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.22 
 
 
471 aa  172  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2509  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.59 
 
 
447 aa  172  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000655646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2301  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.84 
 
 
450 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2475  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.84 
 
 
450 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2900  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  31.59 
 
 
450 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426255  normal  0.0366346 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.14 
 
 
514 aa  170  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1947  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.41 
 
 
459 aa  170  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673176  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.44 
 
 
492 aa  170  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2430  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  31.59 
 
 
458 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.83 
 
 
448 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.18 
 
 
510 aa  169  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.18 
 
 
439 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.34 
 
 
567 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.58 
 
 
474 aa  168  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01970  pre-mRNA splicing factor, putative  30.26 
 
 
1072 aa  167  5e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.77 
 
 
418 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.95 
 
 
510 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3324  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.36 
 
 
446 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0917  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.56 
 
 
418 aa  167  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.577539  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  30.75 
 
 
476 aa  166  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  30.07 
 
 
452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1537  predicted protein  29.74 
 
 
394 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.935265 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0960  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.77 
 
 
451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.25993  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2108  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.54 
 
 
418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.84 
 
 
485 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2139  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.34 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1017  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.27 
 
 
535 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.32 
 
 
463 aa  165  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  30.5 
 
 
551 aa  165  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.07 
 
 
506 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0037  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.9 
 
 
460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  31.12 
 
 
481 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0998  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.13 
 
 
451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1052  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.27 
 
 
535 aa  164  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87146  predicted protein  30.92 
 
 
480 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000232549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  32.36 
 
 
530 aa  164  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05931  ATP-dependent RNA helicase dbp2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0J9]  30.41 
 
 
563 aa  164  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111979  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  29.98 
 
 
506 aa  164  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4603  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.58 
 
 
557 aa  164  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884442  normal  0.136344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  30.83 
 
 
477 aa  163  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.02 
 
 
432 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1136  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.55 
 
 
447 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1254  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.6 
 
 
481 aa  163  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10557  ATP-dependent RNA helicase ded1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C2M6]  30.16 
 
 
668 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.645505 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10782  predicted protein  28.91 
 
 
417 aa  162  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.51 
 
 
437 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3707  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.41 
 
 
381 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.34 
 
 
477 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2503  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.8 
 
 
506 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3401  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.07 
 
 
432 aa  161  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.571925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.08 
 
 
497 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1595  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.2 
 
 
428 aa  161  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000842121  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0709  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.44 
 
 
422 aa  161  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0565  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.41 
 
 
442 aa  161  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0074  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.47 
 
 
450 aa  160  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  32.06 
 
 
527 aa  160  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.36 
 
 
513 aa  160  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0299  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.01 
 
 
364 aa  160  6e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.3 
 
 
491 aa  160  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  28.48 
 
 
491 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.13 
 
 
418 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.8 
 
 
678 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1819  ATP-dependent RNA helicase protein  28.5 
 
 
413 aa  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.832853  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1743  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.01 
 
 
479 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.236928 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.71 
 
 
438 aa  159  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.477524  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2639  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.68 
 
 
525 aa  159  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.147285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.68 
 
 
443 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1820  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30 
 
 
447 aa  159  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0987  DEAD/DEAH box helicase-like  30.14 
 
 
418 aa  159  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748999  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0115  DEAD/DEAH box helicase-like  32.56 
 
 
451 aa  159  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.55 
 
 
504 aa  159  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_2097  predicted protein  29.95 
 
 
552 aa  159  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143499  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.21 
 
 
499 aa  159  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4337  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.23 
 
 
485 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2715  putative ATP-dependent RNA helicase  29.61 
 
 
434 aa  158  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511993  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0631  putative ATP-dependent RNA helicase 2  29.09 
 
 
494 aa  158  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640854  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87539  pre-mRNA processing RNA-helicase  29.44 
 
 
875 aa  158  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.223181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.5 
 
 
506 aa  158  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  30.66 
 
 
469 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4277  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.23 
 
 
485 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3027  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.23 
 
 
414 aa  158  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1018  ATP-dependent RNA helicase RhlE  31.4 
 
 
397 aa  157  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>