More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2944 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3310  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  80.36 
 
 
443 aa  685    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.899565  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1136  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  74.11 
 
 
447 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
438 aa  881    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.477524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  81.31 
 
 
443 aa  697    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.650391  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0960  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  72.81 
 
 
451 aa  636    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.25993  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0998  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  72.81 
 
 
451 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0962  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  75.41 
 
 
443 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0923709  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  81.26 
 
 
443 aa  694    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0661425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1046  DEAD/DEAH box helicase domain protein  81.26 
 
 
443 aa  691    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0103787  decreased coverage  0.0000000602754 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0903  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.78 
 
 
429 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1184  DEAD/DEAH box helicase-like protein  55.2 
 
 
465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000204696  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0248  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  55.14 
 
 
428 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0971  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.09 
 
 
410 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000971191  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  44.56 
 
 
480 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.34 
 
 
477 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0565  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  40.41 
 
 
442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0654  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.36 
 
 
439 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000031459  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4766  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  45.1 
 
 
443 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110868  decreased coverage  0.00101931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.1 
 
 
443 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00424195  normal  0.0145877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.1 
 
 
443 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00319736  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.97 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  40.49 
 
 
445 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001496  ATP-dependent RNA helicase  40.87 
 
 
416 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.16101  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4297  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  45.13 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3728  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.81 
 
 
447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201471  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.68 
 
 
550 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.99 
 
 
496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4664  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  45.13 
 
 
442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.03 
 
 
599 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3401  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  45.3 
 
 
432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.571925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1454  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.35 
 
 
441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2529  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.47 
 
 
426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10010  DEAD/DEAH box ATP-dependent RNA helicase  43.73 
 
 
434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00123792  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.01 
 
 
525 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.01 
 
 
525 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  44.13 
 
 
522 aa  303  6.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.01 
 
 
526 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.97 
 
 
494 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05933  hypothetical protein  40.62 
 
 
421 aa  302  9e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3579  DEAD/DEAH box helicase-like  43.24 
 
 
421 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0709  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.73 
 
 
422 aa  301  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  41.28 
 
 
495 aa  301  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.33 
 
 
513 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.97 
 
 
515 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1532  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  43 
 
 
441 aa  300  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  42.55 
 
 
557 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.88 
 
 
598 aa  300  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0368123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.27 
 
 
581 aa  299  7e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.83 
 
 
506 aa  299  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2495  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.55 
 
 
427 aa  298  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1974  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.33 
 
 
438 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.69 
 
 
443 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42 
 
 
427 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.44 
 
 
432 aa  297  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0424079 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000199  ATP-dependent RNA helicase  43.72 
 
 
419 aa  297  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00545239  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1422  4a-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  41.53 
 
 
427 aa  296  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.219008 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.83 
 
 
577 aa  296  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.83 
 
 
578 aa  296  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  44.3 
 
 
435 aa  296  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4920  DEAD/DEAH box helicase-like  42.82 
 
 
446 aa  296  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00126468  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0025  DEAD/DEAH box helicase-like  43.5 
 
 
398 aa  296  7e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2938  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42 
 
 
427 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71109  normal  0.0696862 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.47 
 
 
427 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.404894  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.48 
 
 
451 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.01 
 
 
565 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.24 
 
 
492 aa  295  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.57 
 
 
491 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.29 
 
 
628 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42 
 
 
427 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  43.08 
 
 
527 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.28 
 
 
453 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  42.04 
 
 
540 aa  294  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.28 
 
 
453 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.28 
 
 
453 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  42.24 
 
 
429 aa  294  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.28 
 
 
453 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.28 
 
 
453 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.01 
 
 
560 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1434  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.53 
 
 
427 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0791  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.95 
 
 
624 aa  294  2e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000437602  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1745  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.2 
 
 
432 aa  293  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.53 
 
 
427 aa  294  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0112372 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.35 
 
 
479 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.43 
 
 
452 aa  293  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.37 
 
 
497 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.35 
 
 
480 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40 
 
 
466 aa  293  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  41.89 
 
 
527 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  43.22 
 
 
579 aa  293  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2710  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.28 
 
 
428 aa  293  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.57 
 
 
511 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.99 
 
 
462 aa  292  7e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  42.75 
 
 
425 aa  292  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.86 
 
 
489 aa  292  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0627  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.63 
 
 
480 aa  292  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1820  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.86 
 
 
447 aa  292  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  42.63 
 
 
484 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.63 
 
 
486 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  42.63 
 
 
486 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.63 
 
 
486 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>