More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1049 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1049  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
459 aa  954    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.397749  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1569  ATP-dependent DNA helicase RecQ  69.37 
 
 
459 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1538  ATP-dependent DNA helicase RecQ  69.37 
 
 
459 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.72 
 
 
497 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0436  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.84 
 
 
503 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1367  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.73 
 
 
509 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501878  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0760  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.31 
 
 
479 aa  282  1e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.52 
 
 
509 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50409e-40 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1646  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.52 
 
 
509 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1366  ATP-dependent DNA helicase Q  36 
 
 
509 aa  279  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000433489  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.88 
 
 
509 aa  276  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000181661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1208  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.44 
 
 
515 aa  276  6e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000154408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1394  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.85 
 
 
509 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000165058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1505  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.85 
 
 
509 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000020318  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1540  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.85 
 
 
509 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.07 
 
 
509 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000127885  hitchhiker  1.2294e-16 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.88 
 
 
626 aa  265  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.33 
 
 
793 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.69 
 
 
552 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.56 
 
 
611 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.65 
 
 
609 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.35 
 
 
609 aa  257  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.35 
 
 
609 aa  257  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.35 
 
 
593 aa  258  2e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.35 
 
 
611 aa  257  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.35 
 
 
611 aa  257  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  35.35 
 
 
611 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.65 
 
 
611 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.35 
 
 
609 aa  256  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  35.35 
 
 
609 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  36.83 
 
 
698 aa  255  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1290  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.87 
 
 
616 aa  255  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.289447  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.95 
 
 
609 aa  254  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_002950  PG0416  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.19 
 
 
725 aa  253  5.000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.65575 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.3 
 
 
620 aa  252  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.19 
 
 
611 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.88 
 
 
615 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.88 
 
 
615 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.88 
 
 
615 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.88 
 
 
615 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.88 
 
 
615 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.97 
 
 
601 aa  249  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.43 
 
 
608 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.89 
 
 
607 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.41 
 
 
594 aa  248  1e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.26 
 
 
681 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.19 
 
 
599 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.74 
 
 
707 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1359  DEAD/DEAH box helicase  32.6 
 
 
681 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.73 
 
 
625 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0027  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.6 
 
 
681 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0879817  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.08 
 
 
603 aa  247  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.18 
 
 
615 aa  247  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.41 
 
 
736 aa  246  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.21 
 
 
607 aa  246  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1902  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.72 
 
 
630 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204638  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.19 
 
 
608 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.81 
 
 
599 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1262  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.79 
 
 
634 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.92 
 
 
617 aa  244  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.58 
 
 
599 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.49 
 
 
606 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.57 
 
 
674 aa  242  9e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.39 
 
 
598 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.18 
 
 
714 aa  242  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.18 
 
 
596 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.65 
 
 
607 aa  241  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.49 
 
 
607 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09613  ATP-dependent DNA helicase recQ  38.95 
 
 
632 aa  240  2.9999999999999997e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.66 
 
 
608 aa  240  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.17 
 
 
602 aa  240  5e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.11 
 
 
606 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0514  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.74 
 
 
599 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.29 
 
 
593 aa  239  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.29 
 
 
593 aa  239  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1840  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.26 
 
 
486 aa  239  9e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.747153  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.41 
 
 
737 aa  239  9e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0137  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.58 
 
 
631 aa  239  9e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.837204  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.19 
 
 
617 aa  238  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.1 
 
 
707 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4553  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.58 
 
 
864 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3780  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.39 
 
 
642 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.37 
 
 
451 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.29 
 
 
624 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.64 
 
 
563 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.57 
 
 
705 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.91 
 
 
646 aa  236  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0775  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.67 
 
 
733 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.51 
 
 
546 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.01 
 
 
592 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.12 
 
 
729 aa  236  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.26 
 
 
607 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.26 
 
 
607 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21731  superfamily II DNA helicase  36.36 
 
 
497 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0973141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.26 
 
 
607 aa  236  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0369  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.75 
 
 
642 aa  236  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.79 
 
 
610 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.49 
 
 
615 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.21 
 
 
610 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.56 
 
 
613 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>