More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1840 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1840  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
486 aa  971    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.747153  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  85.11 
 
 
470 aa  800    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0784099 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21731  superfamily II DNA helicase  74.29 
 
 
497 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0973141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.46 
 
 
709 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.9 
 
 
718 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.13 
 
 
731 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.61 
 
 
709 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.61 
 
 
709 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1570  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.8 
 
 
722 aa  359  6e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.11 
 
 
611 aa  343  5e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 
611 aa  343  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  39.11 
 
 
611 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 
609 aa  342  5.999999999999999e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 
609 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  39.11 
 
 
609 aa  342  7e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.91 
 
 
611 aa  342  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 
609 aa  342  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.79 
 
 
609 aa  340  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.91 
 
 
615 aa  339  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.91 
 
 
615 aa  339  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.91 
 
 
615 aa  338  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.91 
 
 
615 aa  338  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.72 
 
 
609 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.86 
 
 
608 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.1 
 
 
611 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.72 
 
 
615 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.89 
 
 
607 aa  336  5.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.86 
 
 
608 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0061  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.45 
 
 
647 aa  333  3e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.95 
 
 
725 aa  333  5e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.43 
 
 
881 aa  332  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.05 
 
 
599 aa  330  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.1 
 
 
611 aa  328  9e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.66 
 
 
610 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.66 
 
 
610 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  38.59 
 
 
698 aa  328  1.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.66 
 
 
597 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  34.85 
 
 
724 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.71 
 
 
617 aa  326  5e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.83 
 
 
736 aa  326  5e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.51 
 
 
705 aa  325  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.46 
 
 
614 aa  323  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.88 
 
 
606 aa  323  4e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.17 
 
 
625 aa  323  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.61 
 
 
598 aa  323  5e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.45 
 
 
737 aa  322  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.9 
 
 
620 aa  320  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.81 
 
 
712 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.81 
 
 
711 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.93 
 
 
607 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0015  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.05 
 
 
656 aa  317  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.75 
 
 
602 aa  318  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.4 
 
 
602 aa  318  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  41.21 
 
 
615 aa  317  3e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.6 
 
 
419 aa  316  5e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.76 
 
 
626 aa  315  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00196  ATP-dependent DNA helicase  39.39 
 
 
613 aa  315  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.94 
 
 
729 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.93 
 
 
603 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0775  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.69 
 
 
733 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.64 
 
 
710 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.75 
 
 
715 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.83 
 
 
612 aa  313  4.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.72 
 
 
709 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  39.25 
 
 
493 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.65 
 
 
603 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.8 
 
 
707 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2656  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.93 
 
 
790 aa  312  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343812  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.1 
 
 
599 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  41.53 
 
 
608 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.77 
 
 
626 aa  310  2.9999999999999997e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  41.29 
 
 
608 aa  310  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.69 
 
 
601 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.08 
 
 
600 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.34 
 
 
599 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3687  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.91 
 
 
612 aa  310  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  39.88 
 
 
600 aa  310  4e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.76 
 
 
601 aa  310  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.12 
 
 
611 aa  310  5e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.12 
 
 
611 aa  310  5e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.57 
 
 
610 aa  310  5e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0443  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.27 
 
 
685 aa  309  8e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.52 
 
 
709 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 
715 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.09 
 
 
596 aa  307  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1047  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.88 
 
 
657 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.12 
 
 
626 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.91 
 
 
715 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3529  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.65 
 
 
620 aa  306  6e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.600599  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.53 
 
 
633 aa  306  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33130  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.79 
 
 
607 aa  306  7e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0486618  normal  0.887985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 
715 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.7 
 
 
605 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  38.52 
 
 
709 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.17 
 
 
748 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.51 
 
 
674 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0896  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.79 
 
 
598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.72 
 
 
714 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.31 
 
 
714 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.67 
 
 
607 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>