More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1538 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1049  ATP-dependent DNA helicase RecQ  69.37 
 
 
459 aa  668    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.397749  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1569  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
459 aa  948    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1538  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
459 aa  948    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0436  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.78 
 
 
503 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.4 
 
 
497 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0760  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.47 
 
 
479 aa  285  9e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1367  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.88 
 
 
509 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.31 
 
 
509 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000181661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.67 
 
 
509 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50409e-40 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1646  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.46 
 
 
509 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1366  ATP-dependent DNA helicase Q  42.01 
 
 
509 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000433489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1208  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.73 
 
 
515 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000154408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1540  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.25 
 
 
509 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1394  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.25 
 
 
509 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000165058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.05 
 
 
552 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1505  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.25 
 
 
509 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000020318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.26 
 
 
509 aa  256  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000127885  hitchhiker  1.2294e-16 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.51 
 
 
611 aa  256  7e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1359  DEAD/DEAH box helicase  33.41 
 
 
681 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0027  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.41 
 
 
681 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0879817  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.21 
 
 
620 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.46 
 
 
646 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.36 
 
 
625 aa  249  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.09 
 
 
707 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1290  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.81 
 
 
616 aa  248  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.289447  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.19 
 
 
611 aa  247  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.41 
 
 
681 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.19 
 
 
793 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.89 
 
 
606 aa  246  8e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.02 
 
 
608 aa  245  9e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4553  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.06 
 
 
864 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.37 
 
 
705 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  33.92 
 
 
705 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.37 
 
 
705 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.41 
 
 
608 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.31 
 
 
705 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.31 
 
 
705 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0416  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.49 
 
 
725 aa  243  5e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.65575 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.48 
 
 
592 aa  243  5e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.7 
 
 
705 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.51 
 
 
593 aa  243  5e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.41 
 
 
607 aa  243  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  33.7 
 
 
705 aa  243  7e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01900  ATP-dependent DNA helicase recQ  34.65 
 
 
698 aa  243  7.999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490742  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.31 
 
 
705 aa  242  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.11 
 
 
602 aa  242  9e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.64 
 
 
607 aa  242  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.29 
 
 
626 aa  241  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.55 
 
 
630 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.85 
 
 
605 aa  241  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00245617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.09 
 
 
705 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.7 
 
 
705 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3334  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.19 
 
 
679 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.87 
 
 
731 aa  241  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.01 
 
 
598 aa  240  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.02 
 
 
706 aa  240  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.79 
 
 
606 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.28 
 
 
624 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.88 
 
 
599 aa  239  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.87 
 
 
607 aa  239  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.63 
 
 
568 aa  239  9e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.87 
 
 
626 aa  238  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2659  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.19 
 
 
679 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.25 
 
 
614 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 
610 aa  237  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 
597 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2051  superfamily II DNA/RNA helicase  37.93 
 
 
637 aa  237  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000195113  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2656  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.44 
 
 
790 aa  237  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343812  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 
610 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.45 
 
 
599 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09613  ATP-dependent DNA helicase recQ  36.57 
 
 
632 aa  236  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.28 
 
 
593 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.28 
 
 
593 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.94 
 
 
714 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.18 
 
 
615 aa  236  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.97 
 
 
602 aa  236  7e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.41 
 
 
599 aa  236  8e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1902  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.43 
 
 
630 aa  236  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204638  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  29.96 
 
 
546 aa  236  9e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.41 
 
 
728 aa  236  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.67 
 
 
717 aa  236  9e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.57 
 
 
607 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.73 
 
 
707 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.8 
 
 
619 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.85 
 
 
603 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.89 
 
 
590 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.57 
 
 
611 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.05 
 
 
637 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.33 
 
 
596 aa  234  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.41 
 
 
601 aa  234  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.15 
 
 
729 aa  234  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.81 
 
 
607 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.41 
 
 
611 aa  233  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.41 
 
 
609 aa  233  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.41 
 
 
609 aa  233  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.41 
 
 
611 aa  233  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.66 
 
 
617 aa  233  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.81 
 
 
607 aa  233  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.41 
 
 
609 aa  233  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 
607 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>