40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4850 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4850  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  100 
 
 		 1096 aa  2191    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.829455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2808  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  34.42 
 
 		 933 aa  445  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4478  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  34.06 
 
 		 967 aa  415  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2872  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  27.17 
 
 		 1209 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0051  CRISPR-associated HD domain-containing protein  29.95 
 
 		 921 aa  159  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3147  CRISPR-associated helicase Cas3, Anaes-subtype  26.63 
 
 		 893 aa  137  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  29.04 
 
 		 873 aa  122  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  24.52 
 
 		 843 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  25.6 
 
 		 828 aa  97.8  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  23.85 
 
 		 780 aa  86.3  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  25.58 
 
 		 799 aa  62.4  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  19.75 
 
 		 737 aa  57.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  27.51 
 
 		 763 aa  55.1  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  22.39 
 
 		 651 aa  54.3  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  45.59 
 
 		 781 aa  53.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.1 
 
 		 962 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  45.59 
 
 		 779 aa  52.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  34.25 
 
 		 804 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  24.17 
 
 		 764 aa  51.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  29.2 
 
 		 904 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  42.25 
 
 		 795 aa  50.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.62 
 
 		 885 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  42.25 
 
 		 783 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  23.13 
 
 		 854 aa  48.9  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.62 
 
 		 970 aa  48.5  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  26.14 
 
 		 729 aa  48.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  24.9 
 
 		 741 aa  48.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  25 
 
 		 726 aa  47  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  34.65 
 
 		 883 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  24.37 
 
 		 762 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5312  hypothetical protein  29.33 
 
 		 625 aa  45.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  24.31 
 
 		 750 aa  45.4  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1152  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 		 565 aa  45.1  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000790776  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  47.73 
 
 		 741 aa  45.1  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0978  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 		 558 aa  45.1  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000628602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  55.56 
 
 		 750 aa  45.1  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  24.45 
 
 		 888 aa  45.1  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  24.45 
 
 		 888 aa  44.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  26.24 
 
 		 801 aa  44.7  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 		 829 aa  44.7  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>