111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0663 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0663  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  100 
 
 		 738 aa  1471    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.98376  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  56.93 
 
 		 792 aa  736    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  34.27 
 
 		 794 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3002  CRISPR-associated helicase Cas3  33.51 
 
 		 794 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  30.86 
 
 		 651 aa  194  7e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  29.56 
 
 		 880 aa  162  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.61 
 
 		 724 aa  130  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  22.04 
 
 		 753 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.19 
 
 		 824 aa  126  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.27 
 
 		 820 aa  125  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  22.85 
 
 		 732 aa  124  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  29.53 
 
 		 800 aa  122  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  28.62 
 
 		 733 aa  121  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  22.01 
 
 		 1084 aa  121  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  22.22 
 
 		 829 aa  120  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  21.38 
 
 		 740 aa  120  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  21.34 
 
 		 724 aa  119  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  25.77 
 
 		 904 aa  119  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  26.88 
 
 		 765 aa  118  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  27.27 
 
 		 772 aa  118  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  27.2 
 
 		 804 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  26.16 
 
 		 784 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  26.35 
 
 		 730 aa  118  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  28.51 
 
 		 836 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  23.17 
 
 		 731 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  23.36 
 
 		 661 aa  116  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  24.37 
 
 		 777 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  24.31 
 
 		 776 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  22.37 
 
 		 825 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1436  CRISPR-associated helicase Cas3  21.19 
 
 		 667 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  24.95 
 
 		 728 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  25.46 
 
 		 801 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  21.88 
 
 		 717 aa  114  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1295  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  24.58 
 
 		 692 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  21.76 
 
 		 745 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  22.38 
 
 		 744 aa  112  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  21.06 
 
 		 751 aa  111  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  25.77 
 
 		 783 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  24.77 
 
 		 782 aa  110  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  28.41 
 
 		 778 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  21.05 
 
 		 752 aa  110  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  20.7 
 
 		 722 aa  109  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  24.73 
 
 		 821 aa  108  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  21.38 
 
 		 722 aa  107  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  23.04 
 
 		 745 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  26.6 
 
 		 834 aa  106  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  28.65 
 
 		 807 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  22.76 
 
 		 732 aa  106  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.27 
 
 		 821 aa  105  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  30.13 
 
 		 800 aa  105  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  23.94 
 
 		 1078 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  20.97 
 
 		 792 aa  103  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  20.31 
 
 		 794 aa  103  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3582  CRISPR-associated helicase Cas3  22.1 
 
 		 759 aa  101  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  25.28 
 
 		 858 aa  95.5  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  23.04 
 
 		 781 aa  92  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  22.28 
 
 		 739 aa  90.9  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  22.73 
 
 		 805 aa  88.2  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  24.86 
 
 		 864 aa  85.5  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  25.45 
 
 		 822 aa  84.3  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  27.54 
 
 		 737 aa  82  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  24.55 
 
 		 721 aa  81.6  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  25.81 
 
 		 741 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  24.65 
 
 		 783 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  24.08 
 
 		 750 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  28 
 
 		 763 aa  76.6  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  22.81 
 
 		 899 aa  74.3  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  23.72 
 
 		 1027 aa  74.3  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0794  helicase-like protein  20.72 
 
 		 747 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  27.3 
 
 		 744 aa  73.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  25.36 
 
 		 750 aa  72.4  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  23.77 
 
 		 779 aa  71.6  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  23.77 
 
 		 781 aa  70.9  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0239  metal dependent phosphohydrolase  19.42 
 
 		 772 aa  70.5  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  23.39 
 
 		 795 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  26.52 
 
 		 775 aa  70.5  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  24.06 
 
 		 736 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  23.68 
 
 		 804 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  22.53 
 
 		 905 aa  68.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2836  putative helicase  25.99 
 
 		 856 aa  68.9  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  22.82 
 
 		 741 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2186  CRISPR-associated HD domain protein  21.21 
 
 		 729 aa  66.6  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  21.88 
 
 		 729 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  20.83 
 
 		 801 aa  64.7  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3329  putative helicase  25.52 
 
 		 939 aa  64.7  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  23.17 
 
 		 726 aa  63.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  22.47 
 
 		 948 aa  61.6  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  23 
 
 		 885 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  20.1 
 
 		 811 aa  59.3  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  24.92 
 
 		 729 aa  58.9  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  40.28 
 
 		 873 aa  58.5  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  25.58 
 
 		 764 aa  58.2  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  22.31 
 
 		 827 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  19.34 
 
 		 927 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  21.04 
 
 		 971 aa  53.5  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  21.23 
 
 		 854 aa  53.5  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  25.17 
 
 		 843 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  23.17 
 
 		 823 aa  52.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  21.58 
 
 		 701 aa  51.6  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  21.98 
 
 		 944 aa  51.2  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>