More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0247 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0247  superfamily II DNA/RNA helicase  100 
 
 		 426 aa  885    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0362  helicase domain-containing protein  45.41 
 
 		 443 aa  385  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3041  helicase domain protein  43.57 
 
 		 499 aa  320  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0601765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3238  helicase domain protein  41.79 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1334  superfamily II DNA/RNA helicase  42.57 
 
 		 425 aa  305  9.000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3730  helicase domain-containing protein  39.7 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000982518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4987  helicase domain-containing protein  39.65 
 
 		 450 aa  276  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0336  helicase, putative  41.5 
 
 		 429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5300  comF operon protein 1  39.64 
 
 		 449 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5358  comF operon protein 1  38.42 
 
 		 449 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0406  superfamily II DNA/RNA helicase  39.49 
 
 		 439 aa  266  7e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.329953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4887  comF operon protein 1  38.15 
 
 		 451 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4872  comF operon protein 1  37.91 
 
 		 449 aa  263  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5282  comF operon protein 1  37.68 
 
 		 449 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000003862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5042  comF operon protein 1  37.44 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5426  ComF operon protein 1  37.44 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5312  comF operon protein 1  39.08 
 
 		 374 aa  249  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5645  comF operon protein 1  39.08 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0073075  hitchhiker  0.000000000065503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4755  helicase domain protein  33.74 
 
 		 623 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000089196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0224  DEAD/DEAH box helicase-like  36.98 
 
 		 453 aa  229  8e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0854119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0417  comF operon protein 1, putative  37.33 
 
 		 387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0774  helicase domain-containing protein  36.58 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.327507  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0791  helicase domain-containing protein  36.58 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0788341  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2259  helicase domain protein  30.61 
 
 		 716 aa  173  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1408  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.6 
 
 		 974 aa  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.45 
 
 		 672 aa  62.8  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  24.68 
 
 		 1174 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.74 
 
 		 819 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.74 
 
 		 819 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  24.68 
 
 		 1170 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  23.72 
 
 		 1165 aa  60.8  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  25 
 
 		 1197 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  24.34 
 
 		 1167 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  27.73 
 
 		 822 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0250  transcription-repair coupling factor  25.83 
 
 		 1134 aa  60.5  0.00000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  24.34 
 
 		 1167 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1951  primosome assembly protein PriA  25.38 
 
 		 801 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05611  primosomal protein N' (replication factor Y)  24.06 
 
 		 757 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.380779  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1706  transcription-repair coupling factor  24.92 
 
 		 1148 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43136  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2864  transcription-repair coupling factor  24.92 
 
 		 1148 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0829666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1598  transcription-repair coupling factor  24.92 
 
 		 1148 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000129728  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1518  transcription-repair coupling factor  30 
 
 		 1195 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  25.73 
 
 		 1169 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.72 
 
 		 671 aa  58.2  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  24.28 
 
 		 1153 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2533  transcription-repair coupling factor  24.32 
 
 		 1164 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00875995  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2487  transcription-repair coupling factor  24.32 
 
 		 1164 aa  57  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203456  hitchhiker  0.00300257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  23.08 
 
 		 1188 aa  57  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  25 
 
 		 1169 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2289  transcription-repair coupling factor  23.86 
 
 		 1160 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00423432  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01110  transcription-repair coupling factor  24.32 
 
 		 1148 aa  57  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.358379  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1236  transcription-repair coupling factor  24.32 
 
 		 1148 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00316475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01118  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1148 aa  57  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.451631  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2924  primosomal protein N' (replication factor Y)  21.99 
 
 		 725 aa  56.6  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1237  transcription-repair coupling factor  24.32 
 
 		 1148 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.792337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2209  transcription-repair coupling factor  24.32 
 
 		 1148 aa  57  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1494  transcription-repair coupling factor  24.32 
 
 		 1148 aa  57  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.44461  normal  0.168665 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2012  transcription-repair coupling factor  24.32 
 
 		 1148 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267728 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0566  replication restart DNA helicase PriA  22.65 
 
 		 815 aa  56.6  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00911754  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05551  primosomal protein N' (replication factor Y)  22.41 
 
 		 747 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.319885 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2778  primosomal protein N' (replication factor Y)  21.72 
 
 		 725 aa  56.6  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2478  transcription-repair coupling factor  24.32 
 
 		 1150 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.349906  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  25.9 
 
 		 1168 aa  56.6  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  25.9 
 
 		 1168 aa  56.6  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2255  transcription-repair coupling factor  23.86 
 
 		 1164 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1617  transcription-repair coupling factor  24.62 
 
 		 1147 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.89425  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.48 
 
 		 901 aa  56.2  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  24.03 
 
 		 1175 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  22.77 
 
 		 1169 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.71 
 
 		 817 aa  56.2  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.74 
 
 		 827 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  26.23 
 
 		 1188 aa  56.2  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30585  predicted protein  21.71 
 
 		 942 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  23.86 
 
 		 835 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  25 
 
 		 1192 aa  55.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4189  primosomal protein N'  24.4 
 
 		 725 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2597  primosomal protein N'(replication factor Y)( helicase)  26.26 
 
 		 815 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.510107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1730  transcription-repair coupling factor  23.86 
 
 		 1160 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119053  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1810  transcription-repair coupling factor  23.86 
 
 		 1160 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.540051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  23.87 
 
 		 1158 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.57 
 
 		 815 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  23.03 
 
 		 1169 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.29 
 
 		 688 aa  55.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2315  primosomal protein N'  24.67 
 
 		 747 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101119  hitchhiker  0.00122833 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.07 
 
 		 818 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1830  primosomal protein N' (replication factor Y)  22.41 
 
 		 747 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  24.52 
 
 		 1148 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1629  transcription-repair coupling factor  23.94 
 
 		 1148 aa  55.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.027535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  25.12 
 
 		 1177 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  23.82 
 
 		 1193 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  24.03 
 
 		 1176 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0485  primosome assembly protein PriA  23.36 
 
 		 730 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2153  transcription-repair coupling factor  24.01 
 
 		 1148 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.164525  hitchhiker  0.0000432293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3081  transcription-repair coupling factor  26.59 
 
 		 1171 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195799  normal  0.080304 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  24.44 
 
 		 1192 aa  53.9  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1292  transcription-repair coupling factor  24.01 
 
 		 1148 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.208562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1969  transcription-repair coupling factor  24.01 
 
 		 1148 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1330  transcription-repair coupling factor  24.01 
 
 		 1148 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266348 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  24.84 
 
 		 1150 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  23.95 
 
 		 1176 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>