More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0406 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0406  superfamily II DNA/RNA helicase  100 
 
 		 439 aa  912    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.329953  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0336  helicase, putative  56.88 
 
 		 429 aa  486  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0362  helicase domain-containing protein  39.04 
 
 		 443 aa  296  6e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0247  superfamily II DNA/RNA helicase  39.49 
 
 		 426 aa  266  7e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3041  helicase domain protein  38.79 
 
 		 499 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0601765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3730  helicase domain-containing protein  35.17 
 
 		 449 aa  263  6e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000982518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5282  comF operon protein 1  35.68 
 
 		 449 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000003862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5300  comF operon protein 1  36.45 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1334  superfamily II DNA/RNA helicase  38 
 
 		 425 aa  256  5e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000453066  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4872  comF operon protein 1  36.45 
 
 		 449 aa  256  6e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4887  comF operon protein 1  36.45 
 
 		 451 aa  256  6e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5426  ComF operon protein 1  35.45 
 
 		 449 aa  256  7e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5042  comF operon protein 1  35.45 
 
 		 451 aa  255  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3238  helicase domain protein  35.43 
 
 		 463 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5358  comF operon protein 1  35.97 
 
 		 449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4987  helicase domain-containing protein  35.41 
 
 		 450 aa  251  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5645  comF operon protein 1  38.29 
 
 		 374 aa  247  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0073075  hitchhiker  0.000000000065503 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5312  comF operon protein 1  38.29 
 
 		 374 aa  243  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0224  DEAD/DEAH box helicase-like  32.52 
 
 		 453 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0854119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4755  helicase domain protein  30.72 
 
 		 623 aa  203  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000089196  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0791  helicase domain-containing protein  38.05 
 
 		 360 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0788341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0774  helicase domain-containing protein  38.05 
 
 		 360 aa  197  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.327507  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0417  comF operon protein 1, putative  34.57 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2259  helicase domain protein  28.25 
 
 		 716 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.88 
 
 		 779 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.93 
 
 		 689 aa  64.7  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  25 
 
 		 688 aa  63.9  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0167  primosomal protein N'  28.95 
 
 		 752 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132621 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.92 
 
 		 685 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3337  primosomal protein n  26.32 
 
 		 746 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0690  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.22 
 
 		 675 aa  58.9  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.100284  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  24.83 
 
 		 1165 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0374  primosomal protein N'  28.8 
 
 		 754 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0607469  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0062  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.72 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.631943  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.57 
 
 		 679 aa  57.8  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2493  primosomal protein N'  25.53 
 
 		 792 aa  57  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  21.96 
 
 		 718 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.32 
 
 		 712 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1855  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.78 
 
 		 901 aa  55.1  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  21.84 
 
 		 765 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0034  DEAD/DEAH box helicase:helicase, C- terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit  24.7 
 
 		 678 aa  55.1  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl058  excinuclease ABC subunit B  30.77 
 
 		 615 aa  54.7  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.09 
 
 		 805 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  21.87 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0620  transcription-repair coupling factor  23.57 
 
 		 1244 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.52 
 
 		 903 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.107258 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  21.6 
 
 		 444 aa  53.5  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2579  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.96 
 
 		 678 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0922078  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.19 
 
 		 671 aa  52.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0185  primosomal protein N'  27.63 
 
 		 752 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  20.8 
 
 		 767 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1344  transcription-repair coupling factor  33 
 
 		 893 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252576  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1530  ATP-dependent DNA helicase RecG  23.3 
 
 		 606 aa  52.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33 
 
 		 893 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0160807  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3121  primosome assembly protein PriA  27.51 
 
 		 825 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  25 
 
 		 672 aa  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0128  primosomal protein n`  24.85 
 
 		 751 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.88 
 
 		 706 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.33 
 
 		 776 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.43 
 
 		 904 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.4 
 
 		 719 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.46 
 
 		 681 aa  51.2  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.78 
 
 		 691 aa  51.2  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.03 
 
 		 687 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.38589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  21.99 
 
 		 706 aa  50.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.43 
 
 		 904 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0524  hypothetical protein  24.51 
 
 		 832 aa  50.4  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.669922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.03 
 
 		 714 aa  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.35 
 
 		 772 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  21.96 
 
 		 787 aa  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  21.45 
 
 		 818 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  36.26 
 
 		 1169 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4062  primosomal protein N'  26.61 
 
 		 804 aa  49.7  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.172877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0165  primosome assembly protein PriA  27.33 
 
 		 843 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  21.88 
 
 		 778 aa  49.7  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  36.26 
 
 		 1168 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1311  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.12 
 
 		 686 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  36.26 
 
 		 1168 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  22.13 
 
 		 1167 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09880  primosomal protein N'  26.98 
 
 		 745 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  23.98 
 
 		 1168 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1286  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.12 
 
 		 686 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  20.82 
 
 		 829 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1511  transcription-repair coupling factor  28.95 
 
 		 1059 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1460  primosome assembly protein PriA  25.51 
 
 		 731 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0161  primosome assembly protein PriA  27.33 
 
 		 835 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.58 
 
 		 706 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0489  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.27 
 
 		 607 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.592541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1319  primosomal protein N'  28.92 
 
 		 805 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.342383  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02560  transcription-repair coupling factor  24.52 
 
 		 1126 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  22.66 
 
 		 908 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1212  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.05 
 
 		 699 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.376481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.24 
 
 		 694 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2030  excinuclease ABC subunit B  27.69 
 
 		 690 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0667365  normal  0.695875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  21.26 
 
 		 700 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0642  transcription-repair coupling factor  31.25 
 
 		 1125 aa  48.9  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0432582  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0594  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.45 
 
 		 686 aa  48.9  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1263  helicase domain protein  23.59 
 
 		 626 aa  48.9  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.429277  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.77 
 
 		 683 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0651  primosome assembly protein PriA  31.37 
 
 		 806 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>