More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2820 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2820  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
556 aa  1114    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00179058  normal  0.0521879 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.58 
 
 
538 aa  681    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240435  decreased coverage  0.00164487 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.86 
 
 
591 aa  410  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.09 
 
 
527 aa  340  5e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.6 
 
 
538 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.14 
 
 
528 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  40.14 
 
 
528 aa  322  8e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.14 
 
 
528 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  40.14 
 
 
528 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.14 
 
 
525 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  40.14 
 
 
525 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  40.14 
 
 
528 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  40.14 
 
 
533 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.46 
 
 
511 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  40.37 
 
 
529 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  41.41 
 
 
572 aa  319  7e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.37 
 
 
597 aa  317  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.08 
 
 
531 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.48 
 
 
541 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1648  DEAD/DEAH box helicase-like  40.72 
 
 
607 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.52 
 
 
533 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.5 
 
 
466 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.94 
 
 
467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14791  putative ATP-dependent RNA helicase  39.29 
 
 
589 aa  313  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459404  normal  0.230286 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0647  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.29 
 
 
589 aa  312  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.176165  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  40.59 
 
 
581 aa  312  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185856  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.6 
 
 
565 aa  311  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  42.89 
 
 
656 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09651  putative ATP-dependent RNA helicase  40.83 
 
 
636 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  40.29 
 
 
623 aa  310  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.42 
 
 
527 aa  310  5e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.55 
 
 
643 aa  309  6.999999999999999e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.4 
 
 
747 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.87 
 
 
694 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0117058 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.13 
 
 
595 aa  307  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3342  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.26 
 
 
607 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000502308  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.01 
 
 
637 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.76 
 
 
474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.29 
 
 
619 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.29 
 
 
622 aa  306  6e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.26 
 
 
527 aa  306  8.000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  38.72 
 
 
485 aa  306  8.000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1407  DEAD/DEAH box helicase-like  42.67 
 
 
624 aa  306  9.000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.721389  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.38 
 
 
602 aa  306  9.000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.16 
 
 
646 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  38.02 
 
 
574 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.05 
 
 
622 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.13 
 
 
599 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.47 
 
 
532 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.93 
 
 
532 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.8 
 
 
557 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.8 
 
 
557 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.8 
 
 
557 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14060  DNA/RNA helicase, superfamily II  40.44 
 
 
669 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.32 
 
 
623 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.08 
 
 
640 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.08 
 
 
640 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.08 
 
 
640 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.08 
 
 
640 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.08 
 
 
640 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1816  DEAD/DEAH box helicase-like  36.43 
 
 
531 aa  301  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.95 
 
 
591 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.54 
 
 
607 aa  300  3e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.017054  normal  0.720031 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10851  putative ATP-dependent RNA helicase  39.16 
 
 
604 aa  301  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.638116  normal  0.290308 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.14 
 
 
610 aa  300  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1774  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.01 
 
 
589 aa  300  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.13 
 
 
589 aa  300  4e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.64 
 
 
532 aa  300  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.67 
 
 
530 aa  300  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1927  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.55 
 
 
594 aa  300  6e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118281  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27821  predicted protein  36.14 
 
 
822 aa  300  6e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  40.15 
 
 
589 aa  299  8e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  44.68 
 
 
561 aa  299  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11320  DNA/RNA helicase, superfamily II  45.74 
 
 
582 aa  299  8e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.381496  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11279  cold-shock deaD-box protein A deaD (ATP-dependent RNA helicase)  42.86 
 
 
563 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.97 
 
 
528 aa  299  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18210  DNA/RNA helicase, superfamily II  42.67 
 
 
614 aa  299  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461192  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0924  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.92 
 
 
599 aa  298  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24549  predicted protein  42.9 
 
 
346 aa  298  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.66 
 
 
539 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  40.98 
 
 
527 aa  296  4e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1307  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.23 
 
 
657 aa  296  5e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.396333 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.59 
 
 
634 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.61 
 
 
584 aa  296  6e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  40.24 
 
 
606 aa  296  7e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.15 
 
 
590 aa  296  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.59 
 
 
605 aa  296  8e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4470  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.23 
 
 
564 aa  296  8e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.230893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.31 
 
 
550 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.67 
 
 
560 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.31662  normal  0.276111 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1854  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.18 
 
 
610 aa  295  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1116  DEAD/DEAH box helicase-like  41.84 
 
 
640 aa  295  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.59 
 
 
611 aa  295  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.71 
 
 
546 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3847  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.67 
 
 
559 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.460611  normal  0.310213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1868  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  39.67 
 
 
559 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0935982  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.69 
 
 
482 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.1 
 
 
528 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  40.1 
 
 
528 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.27 
 
 
561 aa  295  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>