More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1482 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1051 aa  2122    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0811  TonB-dependent receptor  35.83 
 
 		 1016 aa  545  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000353149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 1114 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  34.65 
 
 		 1023 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 1173 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 1029 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 1050 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  32.09 
 
 		 1023 aa  445  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 1037 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1128 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1117 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.94 
 
 		 1161 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1008 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 1000 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 1038 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1006 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1124 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1177 aa  423  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1147 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1071 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1129 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  29.78 
 
 		 1063 aa  412  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 1181 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.23 
 
 		 1027 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 1038 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 1025 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1013 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 979 aa  403  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  29.77 
 
 		 1041 aa  406  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 1006 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 1019 aa  406  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1097 aa  406  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 1090 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1014 aa  401  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  30.99 
 
 		 1137 aa  403  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  30.02 
 
 		 1154 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1096 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1198 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1017 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 1103 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 1128 aa  396  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 1034 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 996 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 996 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1023 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.93 
 
 		 1010 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 1071 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1155 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 1026 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  29.41 
 
 		 1023 aa  387  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  30.82 
 
 		 1102 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 986 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1177 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1066 aa  386  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  29.49 
 
 		 1034 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 1094 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1049 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 994 aa  383  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1122 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1006 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1082 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1064 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1039 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  30.38 
 
 		 1005 aa  379  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 1041 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 1043 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 993 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1076 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 984 aa  380  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1053 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 1065 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1039 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1076 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1079 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 1040 aa  373  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 1144 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 1066 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1084 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 1155 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 1051 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 1020 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 976 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 982 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 1003 aa  369  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 		 1081 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 1140 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 999 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 986 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1012 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1076 aa  365  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 1189 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 		 1047 aa  363  6e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1060 aa  363  8e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 989 aa  362  2e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1113 aa  362  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 1011 aa  362  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 		 1120 aa  361  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1042 aa  361  4e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1132 aa  360  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1125 aa  360  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>