More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2655 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 243 aa  111  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  41.99 
 
 		 217 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 		 208 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  38.35 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 207 aa  95.1  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 208 aa  91.7  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 197 aa  89.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  34.21 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  37.93 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  32.4 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  26.8 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 195 aa  62  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 206 aa  62  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6821  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  25.15 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  34.91 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  36.52 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  30.65 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  27.32 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5129  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 255 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287917  normal  0.539505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>