More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4750 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  71.48 
 
 		 573 aa  793    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  68.99 
 
 		 590 aa  803    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  77.74 
 
 		 575 aa  929    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  78.42 
 
 		 556 aa  905    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  100 
 
 		 574 aa  1167    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  68.52 
 
 		 575 aa  795    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  68.99 
 
 		 575 aa  803    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  70.77 
 
 		 520 aa  760    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  72.35 
 
 		 573 aa  800    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  71.65 
 
 		 573 aa  794    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  72.52 
 
 		 573 aa  793    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  37.83 
 
 		 591 aa  338  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  37.48 
 
 		 585 aa  330  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.04 
 
 		 574 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 592 aa  257  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  32.59 
 
 		 586 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  32.99 
 
 		 573 aa  251  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  32.81 
 
 		 584 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  30.37 
 
 		 562 aa  243  5e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.51 
 
 		 582 aa  239  9e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 607 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  34.13 
 
 		 607 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 607 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.74 
 
 		 571 aa  233  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  33.71 
 
 		 619 aa  230  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  34.14 
 
 		 607 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 607 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 607 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 		 613 aa  226  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  29.23 
 
 		 635 aa  226  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 607 aa  224  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  31.8 
 
 		 613 aa  220  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 613 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  31.9 
 
 		 606 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 616 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  31.63 
 
 		 606 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  31.63 
 
 		 606 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  31.63 
 
 		 606 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  31.63 
 
 		 606 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  31.63 
 
 		 606 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 606 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 606 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 572 aa  207  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  38.3 
 
 		 574 aa  188  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  38.3 
 
 		 599 aa  187  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  36.39 
 
 		 609 aa  187  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  29.03 
 
 		 645 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.71 
 
 		 645 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  29.08 
 
 		 616 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  29.03 
 
 		 642 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 584 aa  179  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  28.57 
 
 		 587 aa  177  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  33.61 
 
 		 595 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  31.53 
 
 		 551 aa  171  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 595 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  28.45 
 
 		 625 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.47 
 
 		 574 aa  160  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  27.32 
 
 		 603 aa  157  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.32 
 
 		 553 aa  156  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  27.09 
 
 		 620 aa  153  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 559 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 594 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  37.45 
 
 		 559 aa  150  5e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.53 
 
 		 564 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  26.31 
 
 		 603 aa  144  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  44.44 
 
 		 494 aa  136  9e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  45.58 
 
 		 495 aa  134  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 606 aa  134  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  36.22 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 594 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  32.3 
 
 		 632 aa  110  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 511 aa  109  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 562 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  27.81 
 
 		 572 aa  106  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 581 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 595 aa  101  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 567 aa  99.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.2 
 
 		 599 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 		 573 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 566 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  26.16 
 
 		 425 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 642 aa  95.9  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  24.01 
 
 		 573 aa  95.1  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  41.41 
 
 		 722 aa  94.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 566 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 572 aa  92  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  28.18 
 
 		 584 aa  92.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  25.56 
 
 		 677 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  30.33 
 
 		 566 aa  90.5  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  27.34 
 
 		 621 aa  90.1  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  27.34 
 
 		 621 aa  90.1  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 		 573 aa  90.1  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  24.3 
 
 		 573 aa  89  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 568 aa  88.6  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.21 
 
 		 566 aa  88.2  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.74 
 
 		 557 aa  85.1  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 566 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  32.3 
 
 		 583 aa  83.6  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 		 900 aa  83.6  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>