More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2677 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  100 
 
 		 788 aa  1545    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  49.26 
 
 		 790 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  42.26 
 
 		 797 aa  525  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  43.79 
 
 		 755 aa  487  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  36.67 
 
 		 1020 aa  362  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  38.66 
 
 		 931 aa  349  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 		 850 aa  333  6e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  36.84 
 
 		 1025 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  37.9 
 
 		 970 aa  331  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  39.08 
 
 		 715 aa  328  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  37.42 
 
 		 915 aa  324  5e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  35.96 
 
 		 981 aa  321  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  37.67 
 
 		 993 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  32.52 
 
 		 1022 aa  320  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  37.33 
 
 		 965 aa  318  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  36.92 
 
 		 1088 aa  311  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 1048 aa  311  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  35.77 
 
 		 919 aa  310  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 1071 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  37.52 
 
 		 1054 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  36.75 
 
 		 928 aa  289  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  33.59 
 
 		 913 aa  288  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  33.24 
 
 		 741 aa  287  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  35.56 
 
 		 941 aa  287  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  32.59 
 
 		 996 aa  284  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  36.99 
 
 		 908 aa  280  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  35.62 
 
 		 1108 aa  280  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  36.71 
 
 		 1030 aa  280  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  35.06 
 
 		 946 aa  275  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  34.59 
 
 		 1011 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  34.81 
 
 		 956 aa  273  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  32.78 
 
 		 971 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  34.83 
 
 		 928 aa  269  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  35.51 
 
 		 992 aa  267  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  29.06 
 
 		 1027 aa  267  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  34.64 
 
 		 930 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  43.89 
 
 		 1014 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  35.04 
 
 		 814 aa  266  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  33.95 
 
 		 940 aa  264  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  35.68 
 
 		 1008 aa  264  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  41.82 
 
 		 995 aa  264  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  31.68 
 
 		 967 aa  262  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  39.01 
 
 		 921 aa  261  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  34.27 
 
 		 838 aa  261  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  34.72 
 
 		 792 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  40.08 
 
 		 806 aa  261  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  33.79 
 
 		 1021 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  42.23 
 
 		 990 aa  258  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  34.47 
 
 		 1004 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  35.56 
 
 		 690 aa  255  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.87 
 
 		 742 aa  254  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  33.08 
 
 		 1033 aa  253  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.68 
 
 		 964 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  34.52 
 
 		 921 aa  250  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  33.78 
 
 		 1003 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  33.39 
 
 		 934 aa  247  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  33.29 
 
 		 990 aa  247  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  32.62 
 
 		 907 aa  243  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  30.33 
 
 		 1017 aa  243  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  31.89 
 
 		 992 aa  242  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  33.38 
 
 		 775 aa  241  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  31.7 
 
 		 962 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 907 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  41.55 
 
 		 1003 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 993 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  37.25 
 
 		 965 aa  234  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  31.58 
 
 		 1022 aa  234  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  32.76 
 
 		 1003 aa  233  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  39 
 
 		 757 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  32.71 
 
 		 954 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  42.34 
 
 		 1010 aa  226  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  35.24 
 
 		 1013 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  34.27 
 
 		 978 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  31.93 
 
 		 782 aa  221  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  41.62 
 
 		 1001 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  31.28 
 
 		 783 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1805  putative regulator protein  32.41 
 
 		 708 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  36.8 
 
 		 775 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  42.48 
 
 		 1024 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 1346 aa  215  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  31.31 
 
 		 1034 aa  214  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2767  hypothetical protein  33.52 
 
 		 715 aa  213  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  31.69 
 
 		 937 aa  213  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  33.96 
 
 		 950 aa  210  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  29.49 
 
 		 983 aa  205  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  31.15 
 
 		 982 aa  204  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  38.41 
 
 		 989 aa  203  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  31.45 
 
 		 1025 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5351  hypothetical protein  33.04 
 
 		 862 aa  201  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  42.61 
 
 		 612 aa  200  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 896 aa  200  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  35.08 
 
 		 680 aa  197  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 1319 aa  196  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  39.46 
 
 		 1138 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  30.15 
 
 		 827 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  28.51 
 
 		 941 aa  196  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  28.37 
 
 		 834 aa  196  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  39.02 
 
 		 963 aa  193  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0228  transcriptional regulator, XRE family  30.98 
 
 		 770 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00256597  normal  0.277855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  31.31 
 
 		 935 aa  191  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>