More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0429 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 413 aa  795    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  98.55 
 
 		 413 aa  781    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  91.16 
 
 		 413 aa  670    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1373  RND family efflux transporter MFP subunit  79.6 
 
 		 409 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0428  RND family efflux transporter MFP subunit  65.8 
 
 		 408 aa  381  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3826  RND family efflux transporter MFP subunit  65.8 
 
 		 385 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5104  RND family efflux transporter MFP subunit  60.33 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4033  efflux transporter, RND family, MFP subunit  62.88 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1666  efflux transporter, RND family, MFP subunit  62.88 
 
 		 396 aa  372  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  61.28 
 
 		 402 aa  353  4e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4289  efflux transporter, RND family, MFP subunit  61.28 
 
 		 402 aa  352  7e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.43 
 
 		 414 aa  349  6e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1149  RND family efflux transporter MFP subunit  43.16 
 
 		 426 aa  257  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4108  putative secretion protein (HlyD)  45.48 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331978  normal  0.146318 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3888  Fis family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0700006  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  36.05 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  35.77 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3044  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 396 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.68 
 
 		 396 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.167372 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1504  RND family efflux transporter MFP subunit  35.42 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2854  cation efflux transporter  36.72 
 
 		 386 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1439  RND family efflux transporter MFP subunit  36.72 
 
 		 390 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2136  putative transporter lipoprotein transmembrane  34.17 
 
 		 391 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3024  secretion protein HlyD  32.23 
 
 		 363 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.756641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4833  RND family efflux transporter MFP subunit  31.41 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3965  RND family efflux transporter MFP subunit  33.96 
 
 		 362 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000185194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3372  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.15 
 
 		 390 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0461986  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0918  RND family efflux transporter MFP subunit  41.5 
 
 		 302 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.523672  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  31.48 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4105  secretion protein HlyD  34.06 
 
 		 383 aa  135  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0739298  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4022  RND family efflux transporter MFP subunit  32.88 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3030  secretion protein HlyD  42.16 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0446257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3611  secretion protein HlyD  44.2 
 
 		 295 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.711693  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0886  secretion protein HlyD  42.18 
 
 		 306 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.795308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2968  RND family efflux transporter MFP subunit  30.14 
 
 		 413 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222457 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7484  HlyD family secretion protein  31.01 
 
 		 351 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0458  secretion protein HlyD  33.05 
 
 		 378 aa  129  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03087  putative cation-efflux system signal peptide protein  33.88 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4663  RND family efflux transporter MFP subunit  32.39 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0807  RND family efflux transporter MFP subunit  29.53 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2411  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.11 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.17 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4745  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1328  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.5 
 
 		 297 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0895  secretion protein HlyD  38.17 
 
 		 322 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0040  secretion protein HlyD  32.7 
 
 		 389 aa  119  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4685  secretion protein HlyD  43.01 
 
 		 312 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5160  secretion protein HlyD  36.07 
 
 		 295 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.528553  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7282  HlyD family secretion protein  30.58 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0556  HlyD family secretion protein  39.23 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.230089 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3039  secretion protein HlyD  37.97 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0091  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.25 
 
 		 306 aa  117  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0471  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1007  secretion protein HlyD  37.16 
 
 		 317 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163323  normal  0.0478945 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3901  RND family efflux transporter MFP subunit  30.61 
 
 		 396 aa  116  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.11743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3605  secretion protein HlyD  38.5 
 
 		 300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.550781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2928  secretion protein HlyD  30.08 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2621  secretion protein HlyD  32.76 
 
 		 367 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1337  HlyD family secretion protein  41.71 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1002  secretion protein HlyD  39.79 
 
 		 307 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.677003  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.74 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.52 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5660  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.15 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.852771  normal  0.84907 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  30.19 
 
 		 385 aa  106  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  30.42 
 
 		 609 aa  106  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  29.49 
 
 		 340 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0908  HlyD family secretion protein  38.07 
 
 		 300 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3472  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.27 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000321827  normal  0.111591 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4544  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.27 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.80936 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0816  RND family efflux transporter MFP subunit  30.68 
 
 		 385 aa  102  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.63 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  27.2 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000015375  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2353  RND family efflux transporter MFP subunit  25.9 
 
 		 442 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.64 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  29.05 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  28.81 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0549  hypothetical protein  38.59 
 
 		 296 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1021  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.02 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0159772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0890  secretion protein HlyD  37.63 
 
 		 306 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.459513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2400  secretion protein HlyD  26.29 
 
 		 440 aa  97.4  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.68 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.18 
 
 		 380 aa  95.9  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.97 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.42 
 
 		 421 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  29.45 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2665  RND family efflux transporter MFP subunit  27.93 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.82 
 
 		 442 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.15 
 
 		 421 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  29.83 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  27.52 
 
 		 1405 aa  90.9  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  31.23 
 
 		 353 aa  90.9  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  27.54 
 
 		 407 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1700  secretion protein HlyD  25.75 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696744  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  28.73 
 
 		 405 aa  89.7  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.12 
 
 		 397 aa  89.7  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  25.38 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.41 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  27.12 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.24 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>