271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4835 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  100 
 
 		 874 aa  1710    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  31.84 
 
 		 807 aa  331  4e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  32.91 
 
 		 798 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  32.22 
 
 		 798 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  29.15 
 
 		 774 aa  303  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  25.73 
 
 		 790 aa  289  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  26.95 
 
 		 781 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  26.95 
 
 		 781 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  27.28 
 
 		 852 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  29.47 
 
 		 779 aa  233  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  28.62 
 
 		 766 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  28.62 
 
 		 766 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  28.83 
 
 		 766 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  29.56 
 
 		 756 aa  211  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  28.38 
 
 		 766 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  28.61 
 
 		 757 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  30.79 
 
 		 745 aa  202  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  28.22 
 
 		 766 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  28.34 
 
 		 766 aa  200  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  29.5 
 
 		 754 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  29.09 
 
 		 754 aa  194  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  30.76 
 
 		 746 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  30.76 
 
 		 755 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  36.61 
 
 		 785 aa  188  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  28.84 
 
 		 773 aa  188  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  28.57 
 
 		 785 aa  187  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  30.6 
 
 		 755 aa  187  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  29.76 
 
 		 798 aa  185  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  38.73 
 
 		 797 aa  183  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  27.82 
 
 		 855 aa  177  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  27.91 
 
 		 855 aa  177  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  33.33 
 
 		 777 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  35.21 
 
 		 750 aa  152  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  29.29 
 
 		 495 aa  151  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  24.47 
 
 		 619 aa  148  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  28.83 
 
 		 431 aa  142  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  37.22 
 
 		 753 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  37.18 
 
 		 773 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  37.22 
 
 		 762 aa  135  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  37.22 
 
 		 753 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  37.45 
 
 		 766 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  35.82 
 
 		 753 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  37.65 
 
 		 772 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  32.89 
 
 		 790 aa  130  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  27.17 
 
 		 712 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  35.5 
 
 		 801 aa  128  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  35.66 
 
 		 788 aa  128  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  37.21 
 
 		 758 aa  127  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  35.21 
 
 		 758 aa  124  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  34.05 
 
 		 773 aa  123  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  35.66 
 
 		 775 aa  119  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  23.59 
 
 		 723 aa  116  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  34.77 
 
 		 761 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  23.72 
 
 		 676 aa  115  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  26.91 
 
 		 617 aa  114  9e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  29.96 
 
 		 654 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  24.76 
 
 		 739 aa  108  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  25.27 
 
 		 723 aa  107  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  24.14 
 
 		 670 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  24.22 
 
 		 669 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  24.54 
 
 		 574 aa  100  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  24.54 
 
 		 739 aa  97.4  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  22.98 
 
 		 580 aa  95.5  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  23.82 
 
 		 588 aa  85.5  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  24.04 
 
 		 634 aa  80.1  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2515  helicase c2  26.19 
 
 		 917 aa  79  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  25.91 
 
 		 851 aa  77  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  27.08 
 
 		 722 aa  77.4  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.63 
 
 		 934 aa  76.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1918  helicase c2  31.23 
 
 		 790 aa  76.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.885633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  21.21 
 
 		 934 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  26.19 
 
 		 582 aa  74.7  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  33.19 
 
 		 729 aa  74.7  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  21.62 
 
 		 938 aa  73.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.76 
 
 		 934 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.76 
 
 		 934 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.76 
 
 		 934 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  28.02 
 
 		 729 aa  72.8  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.76 
 
 		 934 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.76 
 
 		 934 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.06 
 
 		 934 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  23.82 
 
 		 921 aa  71.2  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2465  helicase c2  25.6 
 
 		 806 aa  71.2  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  19.65 
 
 		 832 aa  71.2  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  21.69 
 
 		 835 aa  70.9  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  25.83 
 
 		 773 aa  70.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  29.91 
 
 		 934 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  28.63 
 
 		 934 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  31.17 
 
 		 673 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  26.24 
 
 		 643 aa  69.7  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  26.88 
 
 		 575 aa  68.9  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.26 
 
 		 952 aa  68.6  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3766  helicase c2  35.77 
 
 		 806 aa  67.8  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.72 
 
 		 692 aa  67.4  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  22.52 
 
 		 537 aa  67  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.24 
 
 		 692 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2975  helicase c2  28.14 
 
 		 807 aa  67.4  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  23.6 
 
 		 791 aa  66.6  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  24.16 
 
 		 674 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.31 
 
 		 929 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>