162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2378 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2378  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 634 aa  1257    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.903959  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2379  peptidoglycan-binding LysM  31.05 
 
 		 698 aa  134  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.829657  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01000  LysM-repeat domain protein  29.45 
 
 		 651 aa  125  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  35.83 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1862  Peptidoglycan-binding LysM  31.51 
 
 		 642 aa  98.2  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.746272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  34.21 
 
 		 384 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2150  LysM domain-containing protein  32.17 
 
 		 501 aa  78.2  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  22.54 
 
 		 620 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.22 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  28.73 
 
 		 547 aa  75.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  26.84 
 
 		 546 aa  76.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  30.08 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  26.67 
 
 		 173 aa  72.8  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  28.27 
 
 		 556 aa  71.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0980  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1588 aa  70.9  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1838  peptidoglycan-binding LysM  32.35 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.858327  unclonable  0.000000000675364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  32 
 
 		 595 aa  68.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  23.53 
 
 		 1001 aa  66.6  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  26.38 
 
 		 179 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  31.11 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.21 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  29.91 
 
 		 661 aa  64.7  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.77 
 
 		 581 aa  64.7  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  27.93 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  25.81 
 
 		 539 aa  63.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  23.36 
 
 		 498 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.63 
 
 		 532 aa  62.4  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.58 
 
 		 377 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.16 
 
 		 840 aa  62  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03671  hypothetical protein  32.4 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.651012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  26.74 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  26.79 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  30.08 
 
 		 542 aa  60.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.06 
 
 		 576 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  30.91 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6487  Peptidoglycan-binding LysM  34.86 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.577671  normal  0.707539 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  29.69 
 
 		 571 aa  59.7  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1708  peptidoglycan-binding LysM  26.44 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0335669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  23.99 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  25.44 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  29.27 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1082  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.93 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.690054  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  26.2 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  31.2 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  31.2 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  31.2 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  31.2 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.94 
 
 		 637 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  26.89 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  30.17 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2915  Peptidoglycan-binding LysM  26.52 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.992614  hitchhiker  0.000000148718 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.09 
 
 		 797 aa  57.4  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.94 
 
 		 593 aa  57.4  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.94 
 
 		 631 aa  57.4  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  33.07 
 
 		 265 aa  57  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  27.27 
 
 		 527 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  29.66 
 
 		 555 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  35.34 
 
 		 265 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  34.48 
 
 		 453 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  23.46 
 
 		 1021 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  40.45 
 
 		 342 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  33.94 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  30.4 
 
 		 265 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  27.08 
 
 		 1079 aa  55.5  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.41 
 
 		 579 aa  55.8  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3030  peptidoglycan lytic transglycosylase-related protein  24.35 
 
 		 583 aa  55.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  20.83 
 
 		 534 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  25.47 
 
 		 324 aa  54.7  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  24.4 
 
 		 552 aa  54.7  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  30.4 
 
 		 265 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  32.8 
 
 		 265 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  25.27 
 
 		 519 aa  54.3  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  26.95 
 
 		 501 aa  53.5  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  29.34 
 
 		 337 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  25.25 
 
 		 409 aa  53.5  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  26.37 
 
 		 553 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0474  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.37 
 
 		 801 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04231  LysM domain-containing protein  27.01 
 
 		 286 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  32.08 
 
 		 849 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  24.32 
 
 		 405 aa  53.5  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  42.22 
 
 		 342 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  24.6 
 
 		 509 aa  53.5  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  22.99 
 
 		 543 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1694  peptidoglycan-binding LysM  25.97 
 
 		 444 aa  53.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  26.72 
 
 		 283 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3231  Peptidoglycan-binding LysM  29.05 
 
 		 390 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0309569 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  29.41 
 
 		 264 aa  52.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  33.64 
 
 		 250 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  39.18 
 
 		 426 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  25.11 
 
 		 515 aa  52  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  25.11 
 
 		 517 aa  52.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  30.16 
 
 		 466 aa  52  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22240  Peptidoglycan-binding LysM  29.59 
 
 		 619 aa  51.6  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  26.54 
 
 		 733 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  30.95 
 
 		 560 aa  51.6  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  32.76 
 
 		 265 aa  52  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  28.71 
 
 		 289 aa  51.2  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  31.87 
 
 		 570 aa  51.2  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  30.17 
 
 		 349 aa  51.2  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0644  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.79 
 
 		 679 aa  51.2  0.00006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.165193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>