More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7177 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  52.61 
 
 		 1103 aa  1015    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 971 aa  1978    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  50.25 
 
 		 1094 aa  965    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  38.64 
 
 		 1119 aa  615  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  37.64 
 
 		 1102 aa  609  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  37.6 
 
 		 996 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  37.41 
 
 		 999 aa  599  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  37.39 
 
 		 1125 aa  597  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0560  TonB-dependent receptor plug  35.19 
 
 		 971 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0108635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  35.82 
 
 		 1047 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  33.37 
 
 		 1137 aa  496  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 1090 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 1003 aa  479  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 1023 aa  476  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  33.91 
 
 		 1005 aa  470  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  32.42 
 
 		 1037 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1051 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 984 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1124 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 1025 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1161 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 976 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1128 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 1004 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 1008 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1012 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 1094 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1037 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  30.58 
 
 		 1053 aa  393  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 989 aa  388  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1066 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 1050 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1006 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1155 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 994 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 1029 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 1038 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 982 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1012 aa  379  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 979 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1076 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1097 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 986 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1079 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1122 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1071 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 988 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1114 aa  373  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 996 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1117 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 1011 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1028 aa  365  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  29.54 
 
 		 977 aa  365  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 993 aa  363  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1076 aa  362  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1013 aa  362  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.33 
 
 		 1010 aa  361  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 1103 aa  361  4e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 1076 aa  360  8e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 1000 aa  360  9e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 1181 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1116 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  29.7 
 
 		 1018 aa  357  5.999999999999999e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  30 
 
 		 1063 aa  357  6.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1023 aa  354  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1027 aa  354  5e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1129 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1038 aa  353  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1021 aa  352  2e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 996 aa  351  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1049 aa  350  6e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 1026 aa  350  9e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  29.42 
 
 		 1023 aa  349  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  27.59 
 
 		 1023 aa  348  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1014 aa  348  3e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1059 aa  348  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1127 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1064 aa  345  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1173 aa  345  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1150 aa  344  4e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1017 aa  343  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1155 aa  343  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  28.65 
 
 		 1096 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1132 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 1008 aa  339  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1051 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  29.21 
 
 		 1042 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 1036 aa  337  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1163 aa  337  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 986 aa  337  7e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1079 aa  337  7.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  28.43 
 
 		 1077 aa  336  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1102 aa  336  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1051 aa  335  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1154 aa  335  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1006 aa  334  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 975 aa  333  9e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 1130 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1148 aa  331  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 1128 aa  331  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>